32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1753 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1753  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  26.77 
 
 		 345 aa  85.9  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 625 aa  77  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.63 
 
 		 633 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  29.69 
 
 		 373 aa  62  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.85 
 
 		 636 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.04 
 
 		 431 aa  58.9  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2204  hypothetical protein  28.97 
 
 		 466 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  24.75 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 178 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 393 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  29.52 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 460 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 219 aa  53.1  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  29.63 
 
 		 215 aa  52.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1883  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.03 
 
 		 413 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 366 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 387 aa  49.7  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 190 aa  48.9  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 190 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0498  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  24.79 
 
 		 404 aa  47  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  31.37 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 196 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0097  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.1 
 
 		 822 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 288 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3548  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.51 
 
 		 313 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.385244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>