141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1124 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  677    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0476  SmpA/OmlA  43.68 
 
 		 233 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1728  SmpA/OmlA domain protein  51.85 
 
 		 135 aa  112  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0776  SmpA/OmlA  33.64 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.880566  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4199  SmpA/OmlA  45.63 
 
 		 173 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1195  SmpA/OmlA  38.76 
 
 		 196 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4509  outer membrane lipoprotein OmlA  43.36 
 
 		 173 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3628  SmpA/OmlA domain-containing protein  39.26 
 
 		 172 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0222  small protein A (tmRNA-binding)-like protein  34.55 
 
 		 183 aa  98.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0701  SmpA/OmlA domain-containing protein  43.69 
 
 		 178 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  hitchhiker  0.0000863527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43020  outer membrane lipoprotein OmlA  45.63 
 
 		 171 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4732  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.94 
 
 		 178 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63030  outer membrane lipoprotein OmlA precursor  36.17 
 
 		 176 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4597  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.32 
 
 		 178 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0944638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5485  outer membrane lipoprotein OmlA  36.17 
 
 		 187 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0935  SmpA/OmlA  47.17 
 
 		 160 aa  95.9  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.970773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0759  SmpA/OmlA  41.59 
 
 		 175 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2622  small protein A  44.76 
 
 		 161 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4731  SmpA/OmlA domain protein  32.35 
 
 		 178 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1654  SmpA/OmlA  40.74 
 
 		 185 aa  92.8  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2836  SmpA/OmlA  45.45 
 
 		 207 aa  92.4  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4554  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.5 
 
 		 185 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1069  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.42 
 
 		 199 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0407  SmpA/OmlA domain protein  44.83 
 
 		 186 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2737  small protein A (tmRNA-binding)-like  36.21 
 
 		 131 aa  90.1  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000974363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0475  SmpA/OmlA domain-containing protein  42.16 
 
 		 182 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4609  SmpA/OmlA  40 
 
 		 170 aa  89.4  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2746  putative lipoprotein transmembrane  42.22 
 
 		 219 aa  89.4  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2051  SmpA/OmlA domain protein  41.44 
 
 		 120 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2975  SmpA/OmlA  41.12 
 
 		 258 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.977187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2575  SmpA/OmlA domain protein  42.7 
 
 		 218 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0754  SmpA/OmlA  35.07 
 
 		 170 aa  87.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3098  SmpA/OmlA  36.92 
 
 		 143 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6008  SmpA/OmlA domain-containing protein  45 
 
 		 193 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3271  SmpA/OmlA domain protein  38.24 
 
 		 183 aa  86.3  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3790  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.67 
 
 		 204 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3923  SmpA/OmlA domain-containing protein  38.24 
 
 		 183 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3384  SmpA/OmlA domain protein  40.17 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2985  SmpA/OmlA domain protein  40.45 
 
 		 218 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0572  putative outer membrane lipoprotein  40.17 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0966  outer membrane lipoprotein  43.3 
 
 		 117 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1906  SmpA/OmlA domain-containing protein  41.58 
 
 		 117 aa  84.3  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1207  outer membrane lipoprotein, putatitve  47.19 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87413  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2736  SmpA/OmlA domain-containing protein  44.57 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3456  outer membrane lipoprotein, putatitve  46.07 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0374  SmpA/OmlA family lipoprotein  36 
 
 		 242 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3419  SmpA/OmlA family lipoprotein  46.07 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3454  SmpA/OmlA family lipoprotein  46.07 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2644  SmpA/OmlA family lipoprotein  46.07 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0230  SmpA/OmlA domain-containing protein  42.53 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2457  outer membrane lipoprotein, putatitve  46.07 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1233  SmpA/OmlA family lipoprotein  46.07 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0252  SmpA/OmlA domain protein  40.23 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0167  SmpA/OmlA  42.39 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0617  SmpA/OmlA domain-containing protein  42.39 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0650  SmpA/OmlA domain-containing protein  42.39 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 625 aa  80.1  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1482  SmpA/OmlA domain-containing protein  41 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3736  outer membrane lipoprotein, SmpA/OmlA  43.48 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0571  SmpA/OmlA domain-containing protein  43.48 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.253801 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0545  SmpA/OmlA domain-containing protein  43.48 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0377  small protein A  38.78 
 
 		 136 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.861991  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2592  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.82 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116933 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01128  hypothetical protein  36.11 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3826  SmpA/OmlA family protein  36.27 
 
 		 144 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336392  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004297  lipoprotein SmpA a component of the essential YaeT outer-membrane protein assembly complex  36.11 
 
 		 119 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1285  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.87 
 
 		 164 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.522478  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3366  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.5 
 
 		 110 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0061494  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2949  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.25 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1410  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.46 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2476  lipoprotein, small protein A  34.74 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1097  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.63 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3049  SmpA/OmlA domain protein  35.29 
 
 		 177 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.331273  normal  0.468309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2773  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.47 
 
 		 174 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664934  normal  0.104565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2851  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.47 
 
 		 174 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1310  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.29 
 
 		 192 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1301  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.29 
 
 		 192 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.84513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1337  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.29 
 
 		 192 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1523  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.78 
 
 		 167 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.512522  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0227  small protein A  41.25 
 
 		 128 aa  71.2  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1460  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.5 
 
 		 130 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.708366  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1517  outer membrane protein  37.5 
 
 		 130 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718257  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1476  small protein A  33.33 
 
 		 163 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0279  lipoprotein, SmpA/OmlA family  37.5 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  31.13 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0457  SmpA/OmlA domain protein  37.5 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1232  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.31 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1271  SmpA/OmlA domain-containing protein  39.74 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175523  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3006  hypothetical protein  37.93 
 
 		 113 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00281492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1058  SmpA/OmlA domain protein  36.78 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276511  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3857  hypothetical protein  36.78 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00570631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02469  hypothetical protein  36.78 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.10509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2775  hypothetical protein  36.78 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2901  hypothetical protein  36.78 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.301484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1067  hypothetical protein  36.78 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261293  normal  0.540177 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2769  hypothetical protein  36.46 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0179366  normal  0.124588 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.73 
 
 		 636 aa  65.9  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1605  Outer membrane lipoprotein OmlA  27.34 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.730668  normal  0.548797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3097  hypothetical protein  35.23 
 
 		 113 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.525418  normal  0.376087 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3687  hypothetical protein  36.78 
 
 		 112 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0028904  normal  0.0506936 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>