85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3004 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 625 aa  1251    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  38.16 
 
 		 345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  37.41 
 
 		 387 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 		 460 aa  107  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 		 393 aa  105  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  34.42 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  38.84 
 
 		 215 aa  99.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  42.73 
 
 		 366 aa  98.2  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  41.32 
 
 		 190 aa  97.1  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  41.32 
 
 		 190 aa  96.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  40.17 
 
 		 178 aa  95.9  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  37.78 
 
 		 344 aa  94.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 319 aa  94.7  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  36.24 
 
 		 196 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 		 188 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2682  TPR domain-containing protein  34.26 
 
 		 283 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2160  TPR domain-containing protein  34.26 
 
 		 240 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1433  TPR domain-containing protein  34.26 
 
 		 240 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2597  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 240 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1657  TPR domain-containing protein  34.26 
 
 		 283 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000896789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3155  TPR domain-containing protein  34.26 
 
 		 240 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2546  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 240 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1940  TPR domain-containing protein  32.41 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.26 
 
 		 254 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  76.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  34.31 
 
 		 251 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 251 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 251 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1753  hypothetical protein  31.67 
 
 		 271 aa  76.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.29 
 
 		 636 aa  75.1  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  33.56 
 
 		 219 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  30.19 
 
 		 342 aa  72.4  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  36.04 
 
 		 216 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 216 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2204  hypothetical protein  32.08 
 
 		 466 aa  67  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.88 
 
 		 302 aa  66.6  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.65 
 
 		 633 aa  65.1  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  37.63 
 
 		 538 aa  61.6  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 646 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.27 
 
 		 432 aa  53.9  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.46 
 
 		 632 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1771  Tetratricopeptide TPR_4  26.32 
 
 		 339 aa  52  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.678894  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.67 
 
 		 431 aa  51.6  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 1454 aa  50.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 1451 aa  50.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 649 aa  50.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 649 aa  50.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0082  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.52 
 
 		 208 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.146117  hitchhiker  0.00321946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  30 
 
 		 1764 aa  49.3  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1582  putative periplasmic protein  26.72 
 
 		 322 aa  49.3  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0498  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.81 
 
 		 404 aa  49.7  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30 
 
 		 642 aa  48.5  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  33.77 
 
 		 594 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  29.9 
 
 		 385 aa  47.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3013  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.13 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 315 aa  45.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  30.77 
 
 		 514 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25.66 
 
 		 837 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  34.38 
 
 		 321 aa  45.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.53 
 
 		 573 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 3145 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 		 273 aa  45.4  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 318 aa  45.8  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  22.54 
 
 		 820 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.05 
 
 		 340 aa  45.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0926  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 148 aa  45.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  31.37 
 
 		 1676 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 649 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 566 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 878 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 686 aa  44.3  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 718 aa  44.3  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 216 aa  44.3  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4106  hypothetical protein  26.55 
 
 		 493 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.532323  decreased coverage  0.00729095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 762 aa  44.3  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  23.9 
 
 		 864 aa  43.9  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>