85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3013 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3013  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 442 aa  915    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.39 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0424  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.08 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0097  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.83 
 
 		 822 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2461  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.47 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0181605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.59 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2204  hypothetical protein  26.7 
 
 		 466 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 		 431 aa  126  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0498  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.04 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1883  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.21 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.3 
 
 		 437 aa  106  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537187  hitchhiker  0.0010338 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1379  hypothetical protein  28.09 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000144326  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3005  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.73 
 
 		 415 aa  99.8  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1347  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.95 
 
 		 414 aa  97.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.16 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.67 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0370  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.94 
 
 		 365 aa  89.4  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1582  putative periplasmic protein  28.17 
 
 		 322 aa  89.4  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0906  hypothetical protein  28.14 
 
 		 325 aa  87.8  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0915  hypothetical protein  28.14 
 
 		 325 aa  88.2  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000355062  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0985  hypothetical protein  28.14 
 
 		 325 aa  88.2  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2084  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.91 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.26 
 
 		 642 aa  79.7  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1135  hypothetical protein  27.95 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0873  60 kDa chaperonin (protein Cpn60; groEL protein)  25.98 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0922  putative periplasmic protein  26.17 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000017161  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  32.74 
 
 		 164 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  32.74 
 
 		 166 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.55 
 
 		 164 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.04 
 
 		 179 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.94 
 
 		 169 aa  58.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  34.06 
 
 		 171 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 194 aa  54.3  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  30.77 
 
 		 187 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.57 
 
 		 179 aa  53.9  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  31.91 
 
 		 186 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.77 
 
 		 171 aa  53.5  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  31.21 
 
 		 171 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  31.21 
 
 		 171 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  29.71 
 
 		 171 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.59 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.62 
 
 		 181 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  30.82 
 
 		 153 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0582  protein of unknown function DUF949  35.16 
 
 		 244 aa  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.380158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.32 
 
 		 167 aa  49.7  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  32.62 
 
 		 160 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.36 
 
 		 166 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  28.25 
 
 		 188 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.06 
 
 		 162 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.07 
 
 		 174 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.81 
 
 		 337 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  30.99 
 
 		 158 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  35.43 
 
 		 167 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.46 
 
 		 171 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.62 
 
 		 160 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  30.5 
 
 		 188 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.5 
 
 		 188 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  30.5 
 
 		 188 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  32.37 
 
 		 157 aa  47  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  31.21 
 
 		 182 aa  47  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  34.35 
 
 		 184 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  34.35 
 
 		 184 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  34.35 
 
 		 184 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  31.47 
 
 		 146 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0389  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.3 
 
 		 241 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 625 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  29.65 
 
 		 184 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.71 
 
 		 167 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.81 
 
 		 192 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.41 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  31.5 
 
 		 168 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1211  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  29.71 
 
 		 238 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  30.25 
 
 		 166 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.69 
 
 		 165 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0926  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.68 
 
 		 249 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.34 
 
 		 331 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.53 
 
 		 179 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  31.5 
 
 		 166 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.47 
 
 		 244 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  31.72 
 
 		 188 aa  43.5  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.75 
 
 		 171 aa  43.5  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0610  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.07 
 
 		 388 aa  43.5  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5418  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.78 
 
 		 252 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0734  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.61 
 
 		 247 aa  43.1  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>