190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2506 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  63.51 
 
 		 366 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  60.54 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  61.49 
 
 		 344 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  62 
 
 		 190 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  56.96 
 
 		 196 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  55.49 
 
 		 393 aa  181  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  62.07 
 
 		 190 aa  181  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  54.55 
 
 		 178 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  60.14 
 
 		 188 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  50.29 
 
 		 387 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  50.3 
 
 		 373 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  47.09 
 
 		 345 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  51.01 
 
 		 319 aa  148  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  46.84 
 
 		 460 aa  141  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.14 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  41.94 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1940  TPR domain-containing protein  44.83 
 
 		 283 aa  124  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  42.67 
 
 		 298 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1657  TPR domain-containing protein  44.06 
 
 		 283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2682  TPR domain-containing protein  44.06 
 
 		 283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2160  TPR domain-containing protein  44.06 
 
 		 240 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3155  TPR domain-containing protein  44.06 
 
 		 240 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2597  TPR repeat-containing protein  44.06 
 
 		 240 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1433  TPR domain-containing protein  44.06 
 
 		 240 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2546  TPR repeat-containing protein  44.06 
 
 		 240 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  41.33 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  41.33 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 251 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  40.67 
 
 		 251 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  40.67 
 
 		 251 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  40.41 
 
 		 251 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  40.41 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  40.15 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  43.59 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  42.15 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  41.51 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  43.81 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 271 aa  91.7  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.62 
 
 		 302 aa  90.1  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 625 aa  80.9  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  49.28 
 
 		 878 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 3172 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.58 
 
 		 632 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.68 
 
 		 820 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.36 
 
 		 810 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 827 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 3301 aa  55.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  30.77 
 
 		 538 aa  55.5  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35 
 
 		 642 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 649 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0926  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 148 aa  52.8  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 3145 aa  52.4  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  31.86 
 
 		 514 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.48 
 
 		 156 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 156 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0811  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 139 aa  52  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 494 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  30.97 
 
 		 625 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 917 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 249 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 502 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.55 
 
 		 1022 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 156 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  35.29 
 
 		 865 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 		 589 aa  48.5  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 750 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3449  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 357 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31 
 
 		 784 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 448 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  26.67 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 527 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.14 
 
 		 576 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 685 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  29.55 
 
 		 1007 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  27.73 
 
 		 681 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 465 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 503 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 792 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  39.13 
 
 		 1764 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 161 aa  45.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  29.46 
 
 		 837 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_002950  PG1967  TPR domain-containing protein  32.38 
 
 		 295 aa  45.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 323 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 750 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 890 aa  45.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.94 
 
 		 988 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 311 aa  45.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 1694 aa  45.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5320  TPR domain protein  30.21 
 
 		 503 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  37.68 
 
 		 340 aa  45.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  29.41 
 
 		 573 aa  45.1  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 879 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.46 
 
 		 155 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5679  TPR domain protein  30.21 
 
 		 503 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5278  TPR domain protein  30.21 
 
 		 503 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.477554  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 374 aa  45.1  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 1827 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>