More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0175 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 156 aa  324  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  65.38 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  65.38 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  58.97 
 
 		 156 aa  197  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  59.35 
 
 		 155 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  55.13 
 
 		 161 aa  191  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  59.62 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  40.87 
 
 		 192 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  38.97 
 
 		 219 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  40.3 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  40 
 
 		 226 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.39 
 
 		 220 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  39.8 
 
 		 221 aa  85.1  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  34.78 
 
 		 224 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  38.4 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 205 aa  80.9  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  34.07 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  37.41 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  37.41 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 290 aa  73.9  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 230 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  34.06 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 		 279 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.39 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 188 aa  60.5  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  32.63 
 
 		 560 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 761 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 927 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.61 
 
 		 707 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.35 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 425 aa  58.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 452 aa  58.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 649 aa  58.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0992  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.999896  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 356 aa  57.4  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  35.56 
 
 		 261 aa  57.4  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 219 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  31.96 
 
 		 398 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 292 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 361 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.79 
 
 		 738 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 1276 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 1534 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.21 
 
 		 1979 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 392 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.47 
 
 		 1694 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  28.26 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.63 
 
 		 1056 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 		 746 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  34.02 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 628 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.95 
 
 		 397 aa  54.3  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 391 aa  53.9  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  29.17 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  30.4 
 
 		 407 aa  53.9  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0858  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.27 
 
 		 479 aa  53.9  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.16 
 
 		 1022 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 515 aa  53.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.21 
 
 		 219 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.85 
 
 		 202 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 247 aa  53.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 202 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.42 
 
 		 462 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 605 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 250 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9777  predicted protein  34.04 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  34.38 
 
 		 643 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 249 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  30.21 
 
 		 306 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.26 
 
 		 261 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.71 
 
 		 784 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 4079 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 3560 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 260 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1967  TPR domain-containing protein  30.53 
 
 		 295 aa  51.6  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 393 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  27.27 
 
 		 295 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 		 201 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  28.28 
 
 		 623 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  28.12 
 
 		 706 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 1406 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>