179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1215 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 224 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  74.07 
 
 		 221 aa  321  5e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  69.19 
 
 		 221 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  70.5 
 
 		 219 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  70.5 
 
 		 220 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  68.42 
 
 		 226 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  64.68 
 
 		 192 aa  260  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  48.17 
 
 		 243 aa  148  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  47.44 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  44.3 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  42.68 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.54 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 		 203 aa  118  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  39.49 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  39.49 
 
 		 175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  37.43 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  40.52 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  39.74 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  38.22 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.22 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  33.18 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.58 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  33.18 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  37.13 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  37.3 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.71 
 
 		 156 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 156 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.3 
 
 		 188 aa  93.2  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  34.33 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.78 
 
 		 156 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  34.03 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.56 
 
 		 155 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  39.33 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.6 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  32.56 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2533  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  38.75 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  26.02 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  29.03 
 
 		 124 aa  61.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63917  Anaphase promoting complex subunit CDC27 (Cell division control protein 27) (Anaphase promoting complex subunit 3)  30.86 
 
 		 571 aa  59.7  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 870 aa  55.5  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 732 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 1534 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  25.81 
 
 		 527 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  30.68 
 
 		 398 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.63 
 
 		 1979 aa  52.4  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0032  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 1445 aa  52  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.36 
 
 		 1838 aa  51.6  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 515 aa  51.6  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 361 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2336  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 413 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.68 
 
 		 988 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 499 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.16 
 
 		 1056 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 649 aa  48.9  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.2 
 
 		 528 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  24.22 
 
 		 815 aa  48.5  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  28.57 
 
 		 560 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 747 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 1371 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 1421 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 1276 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.67 
 
 		 587 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 4079 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  29.7 
 
 		 680 aa  47.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1827 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.73 
 
 		 1154 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  26.47 
 
 		 582 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.04 
 
 		 576 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 699 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.16 
 
 		 738 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 615 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 465 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  32.93 
 
 		 1013 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 1085 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.72 
 
 		 357 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 		 289 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1138 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.77 
 
 		 541 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  23.39 
 
 		 820 aa  45.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.41 
 
 		 397 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  24.74 
 
 		 1252 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  24.65 
 
 		 417 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.19 
 
 		 818 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1722  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 354 aa  45.4  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 428 aa  45.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 352 aa  45.1  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  26.19 
 
 		 706 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 593 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0793  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 152 aa  45.1  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>