76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2063 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 243 aa  477  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.05 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  49.72 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  42.52 
 
 		 221 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  49.71 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  42.34 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  48.28 
 
 		 192 aa  158  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  46.29 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  38.75 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.27 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  39.74 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  34.44 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  34.44 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 194 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  40.48 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.97 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 		 204 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 		 203 aa  89  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.05 
 
 		 202 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 202 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 190 aa  85.5  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 175 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  31.98 
 
 		 190 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.76 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.58 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  28.97 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  32.48 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.41 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.04 
 
 		 155 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.07 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  28.68 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  29.17 
 
 		 706 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2533  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 192 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 156 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  28.42 
 
 		 706 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63917  Anaphase promoting complex subunit CDC27 (Cell division control protein 27) (Anaphase promoting complex subunit 3)  28.92 
 
 		 571 aa  51.2  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  32.93 
 
 		 124 aa  49.3  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  29.65 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 428 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  27.45 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 3560 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  29.89 
 
 		 582 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 361 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 732 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.96 
 
 		 462 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 649 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4917  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.3 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000226435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.17 
 
 		 367 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 161 aa  45.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1922  tetratricopeptide TPR_2  27.08 
 
 		 142 aa  45.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 1421 aa  45.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 4489 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.68 
 
 		 587 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 804 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.54 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 605 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.56 
 
 		 916 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 1827 aa  43.5  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1523  Tfp pilus assembly protein PilF-like protein  31.4 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.546002  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 391 aa  42.7  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 		 1979 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3415  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 638 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241751  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.36 
 
 		 635 aa  42.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 747 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 371 aa  42.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  27.38 
 
 		 314 aa  42  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>