More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1025 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  57.69 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  58.06 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  59.62 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  56.41 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  56.41 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  51.28 
 
 		 161 aa  179  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 190 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  39.39 
 
 		 233 aa  87  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 		 221 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  42.24 
 
 		 124 aa  87  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.72 
 
 		 220 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  36.84 
 
 		 219 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  34.85 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 175 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  37.72 
 
 		 192 aa  85.5  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  37.5 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  35.96 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  39.18 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  34.85 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  34.85 
 
 		 209 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 		 203 aa  74.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.28 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  42.31 
 
 		 211 aa  70.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  42.31 
 
 		 204 aa  70.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 245 aa  67.4  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  32.69 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  34.78 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  37.23 
 
 		 560 aa  65.1  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 		 1276 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  31.86 
 
 		 261 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 307 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 		 4079 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  40.51 
 
 		 247 aa  60.8  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 927 aa  60.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.62 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 543 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 747 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9777  predicted protein  38.3 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  31.52 
 
 		 1056 aa  57.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 3560 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 236 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  36.46 
 
 		 398 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 761 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  30.21 
 
 		 462 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 414 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.31 
 
 		 357 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.51 
 
 		 1979 aa  55.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 617 aa  54.3  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  37.68 
 
 		 1694 aa  54.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 244 aa  54.3  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 301 aa  54.3  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 292 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1192 aa  53.9  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  39.13 
 
 		 577 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 649 aa  53.9  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 291 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 		 371 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1509  tetratricopeptide TPR_2  30.21 
 
 		 341 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 3035 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.29 
 
 		 367 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 465 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.11 
 
 		 632 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 1276 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  40.22 
 
 		 416 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0309  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.143166  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  31.91 
 
 		 623 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 574 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  40.3 
 
 		 515 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 352 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.78 
 
 		 297 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.78 
 
 		 297 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 366 aa  52.4  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 270 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 620 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1733  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.48 
 
 		 538 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.020269 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0793  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 878 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.76 
 
 		 745 aa  51.2  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 213 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1987  heat shock protein DnaJ domain protein  33.94 
 
 		 424 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.657228 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 		 404 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 254 aa  50.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  34.78 
 
 		 715 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 4489 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.12 
 
 		 707 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  29.79 
 
 		 1007 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 246 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  35.87 
 
 		 635 aa  50.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>