More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0309 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0309  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 116 aa  239  9e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.143166  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  41.44 
 
 		 927 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 1276 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  43.36 
 
 		 560 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1000  TPR repeat-containing protein  40.78 
 
 		 486 aa  84.3  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.326539  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  38.94 
 
 		 4079 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 543 aa  80.5  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.04 
 
 		 836 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 366 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.4 
 
 		 1694 aa  77  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  32.14 
 
 		 623 aa  76.6  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  34.23 
 
 		 635 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 562 aa  75.1  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 329 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  33.93 
 
 		 1013 aa  74.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.65 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1138 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 761 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 878 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  38.3 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  35.35 
 
 		 564 aa  72  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  35.78 
 
 		 576 aa  71.2  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  33.33 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 		 707 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 602 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  34.82 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  32.74 
 
 		 1979 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 608 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 1192 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  30.97 
 
 		 743 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 465 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 711 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 523 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 344 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.28 
 
 		 810 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 		 388 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  30.77 
 
 		 1007 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 		 388 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.08 
 
 		 784 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.09 
 
 		 292 aa  67  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 750 aa  66.6  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.91 
 
 		 730 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.3 
 
 		 465 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 1276 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1069 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  37.23 
 
 		 648 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  40.22 
 
 		 471 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.32 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 244 aa  64.7  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  30.09 
 
 		 390 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 1049 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 3560 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  31.96 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 1094 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 935 aa  63.9  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 716 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 245 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.74 
 
 		 632 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 4489 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.95 
 
 		 1022 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 955 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 699 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 740 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 1827 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  31.07 
 
 		 519 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 617 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  34.04 
 
 		 508 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.36 
 
 		 466 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 452 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  31.86 
 
 		 391 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.76 
 
 		 439 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.73 
 
 		 818 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 371 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  33.04 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 352 aa  61.2  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.63 
 
 		 1056 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 301 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1816  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.63 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 466 aa  60.5  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.82 
 
 		 784 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  31.43 
 
 		 745 aa  60.1  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.59 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  30.28 
 
 		 715 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 591 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 361 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 713 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 467 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 465 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>