175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3312 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  100 
 
 
188 aa  381  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.26 
 
 
188 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  46.6 
 
 
190 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  45.55 
 
 
190 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  47.31 
 
 
175 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  45.88 
 
 
194 aa  143  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  45.7 
 
 
245 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  40.15 
 
 
205 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  38.36 
 
 
229 aa  101  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  38.04 
 
 
209 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  38.06 
 
 
221 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  38.65 
 
 
290 aa  97.1  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  36.57 
 
 
226 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 
230 aa  95.5  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  39.68 
 
 
203 aa  94.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.82 
 
 
220 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  36.57 
 
 
192 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  35.82 
 
 
219 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  34.03 
 
 
224 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 
221 aa  91.3  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  36.64 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  34.04 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  37.39 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.39 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.59 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.34 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  36.51 
 
 
261 aa  77.8  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.79 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.06 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.16 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  34.75 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  40.26 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2533  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  29.7 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
161 aa  58.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.21 
 
 
367 aa  54.7  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
1276 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
1192 aa  52  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
1534 aa  52  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
361 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  30.85 
 
 
582 aa  51.2  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
649 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.15 
 
 
746 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
4079 aa  49.3  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 
711 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
810 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  29.46 
 
 
560 aa  48.5  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 
3560 aa  48.5  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  27.22 
 
 
539 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
279 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
289 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
284 aa  48.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 
935 aa  47.8  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.71 
 
 
296 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
878 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 
373 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.7 
 
 
1138 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  27.91 
 
 
398 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.72 
 
 
1979 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
740 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
747 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
718 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
3035 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  26.45 
 
 
233 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 
256 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  26.53 
 
 
706 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
295 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
392 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.29 
 
 
589 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
662 aa  45.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.5 
 
 
1694 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 
356 aa  45.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
3145 aa  45.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 
247 aa  45.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  25.19 
 
 
706 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
593 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
598 aa  45.1  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
562 aa  45.1  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.67 
 
 
289 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.85 
 
 
219 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
1421 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  22.73 
 
 
309 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
1069 aa  44.7  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
1827 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.16 
 
 
267 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.45 
 
 
635 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
1056 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25.32 
 
 
314 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 
371 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 
1252 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>