151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2056 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 233 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  48.72 
 
 		 124 aa  105  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.82 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.3 
 
 		 156 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  35.07 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.64 
 
 		 155 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  33.58 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 190 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 		 156 aa  95.5  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  34.27 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  31.39 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  37.09 
 
 		 175 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  37.09 
 
 		 190 aa  92  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 156 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  38.26 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.45 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.33 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  34.04 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  32.12 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  32.12 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.51 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  30.71 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.83 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  30.53 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.03 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.17 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  25.61 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 392 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.7 
 
 		 746 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 574 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 361 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 594 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 342 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  29.31 
 
 		 527 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  30.85 
 
 		 417 aa  52  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 649 aa  52  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  28.83 
 
 		 577 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.23 
 
 		 820 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.71 
 
 		 1056 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 927 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 605 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  29.03 
 
 		 160 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.84 
 
 		 988 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1276 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.45 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.12 
 
 		 629 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 291 aa  49.3  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.72 
 
 		 528 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63917  Anaphase promoting complex subunit CDC27 (Cell division control protein 27) (Anaphase promoting complex subunit 3)  25.61 
 
 		 571 aa  48.9  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.69 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.69 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.72 
 
 		 1979 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  28.57 
 
 		 929 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  26.72 
 
 		 518 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.79 
 
 		 462 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 593 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.2 
 
 		 474 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1192 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.19 
 
 		 541 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3768  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 299 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 515 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.43 
 
 		 1022 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0793  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 152 aa  46.6  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 318 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  30.59 
 
 		 309 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  28.05 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.74 
 
 		 784 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  27.35 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  27.06 
 
 		 560 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1421 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.74 
 
 		 818 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 188 aa  45.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 452 aa  45.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  29.41 
 
 		 369 aa  45.4  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.19 
 
 		 778 aa  45.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.45 
 
 		 286 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 286 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 890 aa  45.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 747 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.49 
 
 		 738 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 286 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>