More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0138 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 156 aa  319  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 156 aa  319  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  65.38 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  60.65 
 
 		 155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  56.41 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  54.49 
 
 		 161 aa  183  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  56.41 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  41.27 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  37.3 
 
 		 226 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.3 
 
 		 220 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  37.3 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  35.71 
 
 		 224 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 221 aa  90.5  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  35.34 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  34.33 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  33.78 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  33.78 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 230 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  37.76 
 
 		 188 aa  70.5  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 203 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.83 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.77 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.15 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 279 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 307 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.77 
 
 		 201 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.1 
 
 		 202 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.11 
 
 		 1694 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 452 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  40 
 
 		 398 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 927 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 628 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 1276 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  32.11 
 
 		 1979 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.56 
 
 		 730 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  37.08 
 
 		 739 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.55 
 
 		 784 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  32.97 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 3035 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1509  tetratricopeptide TPR_2  30.21 
 
 		 341 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  26.23 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 4079 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 1534 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 361 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 273 aa  54.3  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 1406 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 3560 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  27.37 
 
 		 560 aa  53.9  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.85 
 
 		 707 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 356 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 1276 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0701  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 652 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 435 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  33.7 
 
 		 781 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 243 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 425 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.71 
 
 		 739 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 243 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 392 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.26 
 
 		 1056 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 404 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 605 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 		 247 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5311  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 652 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.118581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.25 
 
 		 742 aa  51.2  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4976  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 652 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128988  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 371 aa  51.2  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3391  tetratricopeptide TPR_2  30.95 
 
 		 652 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  32.32 
 
 		 309 aa  51.2  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.09 
 
 		 219 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9777  predicted protein  34.74 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.89 
 
 		 367 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.09 
 
 		 462 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 254 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 270 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3615  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 353 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.242924  normal  0.313882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 3145 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 212 aa  49.7  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 649 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.77 
 
 		 810 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.03 
 
 		 725 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>