More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2278 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 247 aa  465  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 955 aa  95.5  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.27 
 
 		 1276 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 3560 aa  89.7  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  36.02 
 
 		 740 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  29.23 
 
 		 745 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.3 
 
 		 784 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.28 
 
 		 1056 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 4079 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.89 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  26.6 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.06 
 
 		 632 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.13 
 
 		 810 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 927 aa  82  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 		 988 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 878 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 		 4489 aa  80.1  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 543 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.61 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.9 
 
 		 1056 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.79 
 
 		 818 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.27 
 
 		 1979 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 1192 aa  77.8  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.33 
 
 		 836 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  31.77 
 
 		 1007 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 562 aa  76.6  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 3035 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  34.16 
 
 		 417 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 699 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 662 aa  72.4  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 1094 aa  72.4  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 523 aa  72.4  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 244 aa  72  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.15 
 
 		 1022 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.93 
 
 		 1694 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  30.68 
 
 		 560 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 1276 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  37.5 
 
 		 577 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 1827 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.88 
 
 		 373 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 352 aa  68.9  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.71 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  37.6 
 
 		 574 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1421 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.98 
 
 		 707 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 363 aa  67  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.21 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 754 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 		 608 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 1406 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 711 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 617 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.83 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 416 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  35.25 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.2 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.2 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 754 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.87 
 
 		 576 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  27.84 
 
 		 564 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 935 aa  66.2  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2545  tetratricopeptide domain-containing protein  31.82 
 
 		 672 aa  66.2  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  21.08 
 
 		 515 aa  65.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 649 aa  65.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  26.71 
 
 		 743 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  25.77 
 
 		 573 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.51 
 
 		 875 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  28.86 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 		 713 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.62 
 
 		 730 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 591 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  30.16 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7350  hypothetical protein  30.85 
 
 		 668 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2220  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 430 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.49 
 
 		 784 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 718 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 636 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.54 
 
 		 839 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.44 
 
 		 357 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 602 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.89 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>