222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3257 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
194 aa  394  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  45.55 
 
 
229 aa  175  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  45.55 
 
 
209 aa  174  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  44.38 
 
 
203 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  47.44 
 
 
230 aa  164  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  41 
 
 
204 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  47.1 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  44.16 
 
 
261 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  35.1 
 
 
221 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  38.92 
 
 
190 aa  117  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  37.95 
 
 
190 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 
221 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 
175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  34.86 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  37.34 
 
 
224 aa  111  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  40 
 
 
226 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  37.18 
 
 
219 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.11 
 
 
202 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 
212 aa  103  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
200 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
290 aa  101  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 
205 aa  98.6  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  36.18 
 
 
307 aa  99  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 
202 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.46 
 
 
202 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.14 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
243 aa  85.1  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 
245 aa  85.1  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  34.71 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  31.61 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
156 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.05 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.03 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.38 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.87 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
161 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  27.07 
 
 
194 aa  58.2  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.03 
 
 
1022 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 
499 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  26.85 
 
 
233 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
649 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2533  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  27.06 
 
 
417 aa  55.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
1056 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
988 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 
301 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
301 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.4 
 
 
1979 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.89 
 
 
1056 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
3035 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
1096 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
289 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 
295 aa  51.6  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.92 
 
 
289 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  31.18 
 
 
385 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  29.67 
 
 
295 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
1827 aa  50.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
392 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 
828 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  26.61 
 
 
124 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.66 
 
 
818 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  22.22 
 
 
820 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
1421 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1852  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 
318 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.776683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  27 
 
 
560 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.6 
 
 
784 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
828 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
574 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 
232 aa  48.5  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
169 aa  48.9  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  30.23 
 
 
706 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  28.12 
 
 
680 aa  48.5  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 
1406 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.59 
 
 
462 aa  48.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06840  phosphoprotein phosphatase, putative  31.86 
 
 
586 aa  47.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.66618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28 
 
 
1138 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
1094 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1000  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
486 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.326539  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.47 
 
 
708 aa  47.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 
732 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  30.34 
 
 
577 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 
3145 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
366 aa  46.6  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
884 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  26.74 
 
 
582 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.06 
 
 
745 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
833 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
391 aa  46.6  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
750 aa  46.2  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 
279 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  25.88 
 
 
252 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  32.97 
 
 
269 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
1192 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 
587 aa  46.2  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>