208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0572 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 194 aa  391  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  49.46 
 
 		 190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  47.31 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  51.9 
 
 		 175 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.32 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  45.88 
 
 		 188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  46.83 
 
 		 245 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.62 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  38.18 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 202 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.74 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  36.6 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.63 
 
 		 202 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.74 
 
 		 220 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 230 aa  88.6  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  31.1 
 
 		 229 aa  85.9  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  28.33 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  31.1 
 
 		 209 aa  85.1  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 		 224 aa  84.7  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  28.42 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  30.71 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2533  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  29.13 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.6 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.77 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.65 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  30.77 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  28.46 
 
 		 1240 aa  55.1  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 4079 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 161 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 731 aa  52  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.68 
 
 		 810 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 156 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6772  heat shock protein DnaJ domain protein  30.28 
 
 		 645 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  29.75 
 
 		 124 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 1276 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 156 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 878 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1192 aa  50.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  30.12 
 
 		 295 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2626  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  30.12 
 
 		 295 aa  49.7  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  27.72 
 
 		 306 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 		 249 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 		 249 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 284 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.27 
 
 		 738 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  28.28 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 515 aa  48.9  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 319 aa  48.9  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 279 aa  48.9  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0475  hypothetical protein  34.94 
 
 		 106 aa  48.5  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 392 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 371 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 301 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 404 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  28.12 
 
 		 706 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  28.42 
 
 		 680 aa  47  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0322  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 401 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000024467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 1276 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 708 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1987  heat shock protein DnaJ domain protein  28.28 
 
 		 424 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.657228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 628 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1138 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 662 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.68 
 
 		 292 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 306 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25.71 
 
 		 314 aa  45.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.47 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.59 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  28.87 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 		 1056 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  25.56 
 
 		 309 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  28.09 
 
 		 539 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.77 
 
 		 602 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.77 
 
 		 739 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 711 aa  45.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 556 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.53 
 
 		 746 aa  45.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  29.55 
 
 		 334 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2503  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 409 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 732 aa  45.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.96 
 
 		 561 aa  45.1  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 279 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>