More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1820 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  66.67 
 
 		 187 aa  250  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  38.41 
 
 		 334 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  37.43 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  38.51 
 
 		 306 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  40.43 
 
 		 581 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  40 
 
 		 462 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  37.58 
 
 		 233 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  40 
 
 		 582 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.15 
 
 		 185 aa  99  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  41.27 
 
 		 706 aa  98.6  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.69 
 
 		 219 aa  98.2  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  36.55 
 
 		 306 aa  97.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 1421 aa  97.4  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0096  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 191 aa  95.5  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00110052  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  38.76 
 
 		 706 aa  95.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.4 
 
 		 357 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  35.86 
 
 		 539 aa  94.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0092  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 186 aa  94.4  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 446 aa  92.8  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.5 
 
 		 746 aa  92.8  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.27 
 
 		 308 aa  92  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 361 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1997  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 248 aa  92  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.97 
 
 		 542 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  35.86 
 
 		 649 aa  92.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  35.25 
 
 		 820 aa  90.1  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  39.26 
 
 		 297 aa  89  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.43 
 
 		 406 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.43 
 
 		 406 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 371 aa  87.8  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 		 175 aa  87.8  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 308 aa  87.8  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2669  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 189 aa  87.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00543716  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.09 
 
 		 249 aa  87.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.09 
 
 		 249 aa  87.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  39.66 
 
 		 392 aa  87  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 		 605 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  38.74 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  37.69 
 
 		 428 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  85.9  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 306 aa  85.1  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 1276 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.15 
 
 		 237 aa  85.1  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.14 
 
 		 189 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.88 
 
 		 1022 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 404 aa  84.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 331 aa  84.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  36.3 
 
 		 301 aa  84  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  36.3 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  36.3 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  35.46 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 471 aa  82.4  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0131  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 292 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.47 
 
 		 458 aa  80.9  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.54 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.59 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.82 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  31.48 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 731 aa  79  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 515 aa  79  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 		 391 aa  78.6  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.67 
 
 		 738 aa  78.2  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 292 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.75 
 
 		 988 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0110  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.43 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563747 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 		 376 aa  77.4  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 270 aa  77.4  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.45 
 
 		 778 aa  77.4  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 		 1827 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 732 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 499 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 556 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.3 
 
 		 1056 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  38.14 
 
 		 750 aa  75.9  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  33.94 
 
 		 1240 aa  75.5  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.75 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  39.09 
 
 		 687 aa  75.1  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0055  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 273 aa  75.1  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 290 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 425 aa  74.3  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>