More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2626 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2626  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
169 aa  340  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.22 
 
 
166 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0240215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3390  TPR repeat-containing protein  47.22 
 
 
166 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4354  TPR repeat-containing protein  45.61 
 
 
304 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0844  TPR repeat-containing protein  45.28 
 
 
310 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  44.34 
 
 
260 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.34 
 
 
261 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0815  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.34 
 
 
310 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  44.64 
 
 
280 aa  92.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  48.42 
 
 
706 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 
547 aa  88.6  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
371 aa  88.6  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.68 
 
 
249 aa  88.2  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.68 
 
 
249 aa  87.8  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  44.76 
 
 
271 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  38.68 
 
 
1421 aa  86.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.96 
 
 
373 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  42.45 
 
 
605 aa  84.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  40.18 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  42.72 
 
 
649 aa  83.2  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.35 
 
 
406 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.35 
 
 
406 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  39.81 
 
 
820 aa  80.9  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  38.19 
 
 
361 aa  80.9  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  41.05 
 
 
581 aa  80.9  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  38.68 
 
 
1240 aa  80.9  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  41.75 
 
 
706 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.79 
 
 
237 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 
425 aa  77.8  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.46 
 
 
189 aa  77.4  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
422 aa  77.4  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  38.39 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40 
 
 
738 aa  75.9  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.51 
 
 
219 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  36.15 
 
 
462 aa  74.7  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.18 
 
 
746 aa  74.7  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  40 
 
 
334 aa  74.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 
308 aa  74.3  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 
404 aa  73.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  44.66 
 
 
233 aa  73.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  43 
 
 
582 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  42.11 
 
 
539 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
279 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1089  TPR repeat-containing protein  39.36 
 
 
308 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.527796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1060  TPR repeat-containing protein  39.36 
 
 
308 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 
543 aa  71.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  40.91 
 
 
306 aa  71.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
301 aa  71.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.98 
 
 
818 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  39 
 
 
309 aa  71.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.68 
 
 
542 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0291  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
412 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444686  normal  0.420509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.24 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  38.04 
 
 
499 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 
732 aa  68.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.48 
 
 
778 aa  68.6  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.27 
 
 
357 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  40.48 
 
 
295 aa  68.2  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  41.98 
 
 
295 aa  67.8  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  37.23 
 
 
250 aa  67.4  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.74 
 
 
784 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.63 
 
 
308 aa  67.4  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.446207 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  55 
 
 
306 aa  67.4  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  36.79 
 
 
750 aa  66.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  52.38 
 
 
687 aa  67  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  43.42 
 
 
289 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
331 aa  67  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.56 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.11 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.83 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  36.97 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  41.77 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  43.59 
 
 
1276 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  41.98 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.98 
 
 
988 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  40.66 
 
 
617 aa  65.1  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  35.29 
 
 
259 aa  64.7  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
389 aa  64.7  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1458  TPR repeat-containing protein  38.55 
 
 
410 aa  64.7  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1678  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 
240 aa  64.3  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.51 
 
 
1022 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  43.42 
 
 
295 aa  64.7  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  36.9 
 
 
205 aa  64.3  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
392 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  38.37 
 
 
1007 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.04 
 
 
471 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.11 
 
 
458 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2558  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.29 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.66 
 
 
248 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  37.62 
 
 
385 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 
3560 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 
243 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>