149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2421 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  97.71 
 
 		 175 aa  341  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  83.16 
 
 		 190 aa  320  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.83 
 
 		 188 aa  158  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  51.95 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  46.6 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  46.96 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  42.68 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  42.04 
 
 		 226 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  42.04 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  40.76 
 
 		 221 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.4 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  40.13 
 
 		 192 aa  121  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  41.83 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  39.49 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  37.95 
 
 		 194 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  40.82 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  40.82 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  40.82 
 
 		 230 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.47 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  39.61 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  38.96 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.12 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  36.88 
 
 		 290 aa  97.1  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.83 
 
 		 202 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  37.09 
 
 		 233 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  35.85 
 
 		 261 aa  90.9  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 156 aa  89  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 		 307 aa  88.6  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 156 aa  86.3  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35 
 
 		 155 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.34 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.07 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  35.77 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2533  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.87 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  26.75 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 4079 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.35 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 295 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  31.33 
 
 		 295 aa  53.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  33.33 
 
 		 269 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 290 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  30.12 
 
 		 295 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 361 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  30.34 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 301 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 249 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 249 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  32.88 
 
 		 1138 aa  48.9  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  30.68 
 
 		 398 aa  48.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  24.51 
 
 		 462 aa  48.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 499 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  29.69 
 
 		 577 aa  47.8  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  26.76 
 
 		 560 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  28.03 
 
 		 635 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 291 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 309 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.59 
 
 		 839 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.41 
 
 		 286 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 574 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 366 aa  46.6  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 3560 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 306 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 286 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 708 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.29 
 
 		 1694 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 512 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 1421 aa  45.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 265 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  24.56 
 
 		 417 aa  45.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 178 aa  45.1  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  20.18 
 
 		 458 aa  44.7  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.86 
 
 		 233 aa  44.7  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  28.16 
 
 		 1240 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  38.81 
 
 		 435 aa  44.7  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 1276 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 878 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 404 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1523  Tfp pilus assembly protein PilF-like protein  32.67 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.546002  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1534 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 1094 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 243 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0858  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.66 
 
 		 479 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 		 503 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 292 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>