175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1399 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
226 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  81.86 
 
 
221 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  78.33 
 
 
220 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  75.39 
 
 
219 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  78.74 
 
 
192 aa  291  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  63.72 
 
 
224 aa  275  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  65.88 
 
 
221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  50.93 
 
 
243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  48.1 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  46.79 
 
 
205 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  43.31 
 
 
190 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  42.04 
 
 
190 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  41.4 
 
 
175 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
307 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.57 
 
 
202 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 
245 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 
203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
230 aa  118  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  38.62 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  39.88 
 
 
200 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  33.64 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  39.87 
 
 
211 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  38.03 
 
 
203 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  35.4 
 
 
209 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
194 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  38.22 
 
 
202 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.22 
 
 
202 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.58 
 
 
201 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  37.3 
 
 
156 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.3 
 
 
156 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  40.48 
 
 
261 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.99 
 
 
188 aa  99  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 
156 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  35.07 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.47 
 
 
155 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  35.42 
 
 
188 aa  86.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.09 
 
 
183 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
161 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
212 aa  72  0.000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  31.78 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  31.45 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2533  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  27.36 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
279 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63917  Anaphase promoting complex subunit CDC27 (Cell division control protein 27) (Anaphase promoting complex subunit 3)  31.33 
 
 
571 aa  58.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
732 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.83 
 
 
541 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.88 
 
 
528 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26 
 
 
738 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  30.12 
 
 
398 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.57 
 
 
1138 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
1534 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.79 
 
 
1979 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.81 
 
 
576 aa  52.4  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.61 
 
 
1056 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
699 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
649 aa  52  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.47 
 
 
820 aa  52  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.59 
 
 
988 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.99 
 
 
474 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0032  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
1445 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.79 
 
 
587 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  29.17 
 
 
527 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29 
 
 
1056 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
291 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 
3145 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 
361 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.12 
 
 
1022 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 
1827 aa  50.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
515 aa  50.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
1421 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  23.26 
 
 
1252 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 
295 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  23.26 
 
 
1252 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
718 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.25 
 
 
818 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.81 
 
 
504 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  27.37 
 
 
560 aa  48.9  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
1085 aa  48.5  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 
3560 aa  48.5  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.3 
 
 
784 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1631  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
299 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.863569  normal  0.0840181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 
1838 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 
392 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25.88 
 
 
314 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.27 
 
 
708 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.71 
 
 
289 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1987  heat shock protein DnaJ domain protein  28.89 
 
 
424 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.657228 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
471 aa  47  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 
890 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
713 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 
301 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  24.1 
 
 
295 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 
342 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
421 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
361 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  25.29 
 
 
582 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  24.1 
 
 
295 aa  45.8  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>