More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4894 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 156 aa  323  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  60.65 
 
 		 155 aa  213  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  58.33 
 
 		 161 aa  203  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  58.97 
 
 		 156 aa  197  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  57.69 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  56.41 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  56.41 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  37.14 
 
 		 233 aa  95.5  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  38.6 
 
 		 192 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  36.84 
 
 		 219 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  32.61 
 
 		 190 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 175 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.09 
 
 		 220 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  38.79 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  31.58 
 
 		 226 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  38.2 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  39.33 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  38.3 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  39 
 
 		 605 aa  70.5  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 290 aa  68.2  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  28.89 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 205 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  28.89 
 
 		 209 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.75 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 279 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 246 aa  64.3  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  40.26 
 
 		 649 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 230 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 404 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.85 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  40.26 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 628 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.87 
 
 		 988 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.12 
 
 		 397 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1288  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 329 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.130508  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 392 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.26 
 
 		 1056 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 1534 aa  57.4  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 250 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.66 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 4079 aa  57  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1499  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 329 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00502134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9777  predicted protein  31.91 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 3560 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.19 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 1276 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 878 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.71 
 
 		 632 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  31.11 
 
 		 560 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  30.68 
 
 		 462 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36 
 
 		 2240 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  31.73 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 499 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 367 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63917  Anaphase promoting complex subunit CDC27 (Cell division control protein 27) (Anaphase promoting complex subunit 3)  30.34 
 
 		 571 aa  54.3  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 393 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.4 
 
 		 810 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 927 aa  54.3  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  26.76 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.14 
 
 		 738 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.62 
 
 		 1764 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.12 
 
 		 1022 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1987  heat shock protein DnaJ domain protein  35.64 
 
 		 424 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.657228 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.04 
 
 		 1694 aa  53.9  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1406 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  32.93 
 
 		 338 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 465 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.22 
 
 		 1056 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 747 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  39.13 
 
 		 267 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1509  tetratricopeptide TPR_2  27.84 
 
 		 341 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 273 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 452 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0992  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.999896  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.12 
 
 		 1979 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0032  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 1445 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  31.4 
 
 		 334 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>