209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0032 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  60.59 
 
 
1534 aa  1107    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0032  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1445 aa  2794    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.8 
 
 
1838 aa  422  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4222  TPR repeat-containing protein  39.08 
 
 
1757 aa  277  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 
344 aa  65.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.36 
 
 
344 aa  65.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.64 
 
 
689 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
968 aa  61.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
632 aa  60.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 
3145 aa  57.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  28.92 
 
 
1930 aa  57.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02172  TAL effector AvrBs3/PthA  25.3 
 
 
1086 aa  57.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 
734 aa  57.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
3560 aa  57.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 
632 aa  57.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  27.73 
 
 
725 aa  57  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05609  TAL effector AvrBs3/PthA  25.3 
 
 
1017 aa  56.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00546  TAL effector AvrBs3/PthA  26.42 
 
 
969 aa  57  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.1176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05714  TAL effector AvrBs3/PthA  21.64 
 
 
1483 aa  56.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0599163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03922  TAL effector AvrBs3/PthA  25.79 
 
 
1037 aa  55.8  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147648  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
878 aa  55.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00567  TAL effector AvrBs3/PthA  24.07 
 
 
810 aa  55.5  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109196  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02272  TAL effector AvrBs3/PthA  24.7 
 
 
1107 aa  55.5  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01085  TAL effector AvrBs3/PthA  24.85 
 
 
983 aa  55.5  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000275966  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  21.15 
 
 
979 aa  55.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06234  TAL effector AvrBs3/PthA  24.85 
 
 
983 aa  55.5  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00915225  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.11 
 
 
810 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.75 
 
 
1979 aa  55.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
221 aa  54.3  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02269  TAL effector AvrBs3/PthA  22.89 
 
 
734 aa  54.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.046405  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.09 
 
 
546 aa  54.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05633  TAL effector AvrBs3/PthA  24.1 
 
 
904 aa  53.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00212942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
1180 aa  53.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 
3172 aa  54.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00223  TAL effector AvrBs3/PthA  22.84 
 
 
1068 aa  53.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06229  TAL effector AvrBs3/PthA  24.1 
 
 
904 aa  53.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00614737  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 
1450 aa  54.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45 
 
 
836 aa  53.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 
827 aa  53.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
221 aa  53.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 
156 aa  52.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.52 
 
 
737 aa  53.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.88 
 
 
247 aa  53.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  23.86 
 
 
542 aa  53.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 
1486 aa  53.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.36 
 
 
707 aa  52.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00572  TAL effector AvrBs3/PthA  24.26 
 
 
1047 aa  52.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 
448 aa  52.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
1061 aa  52.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
3035 aa  52.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
265 aa  52.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 
1371 aa  52.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
290 aa  52.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 
740 aa  52.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  29.89 
 
 
224 aa  52  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
3301 aa  52  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  27.98 
 
 
892 aa  52  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01700  translation repressor, putative  37.1 
 
 
1496 aa  52  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
448 aa  52  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25.36 
 
 
681 aa  52  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.48 
 
 
725 aa  52  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  28.72 
 
 
226 aa  52  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.38 
 
 
1034 aa  51.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
465 aa  51.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
1094 aa  51.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
486 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  43.59 
 
 
1694 aa  51.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
615 aa  51.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.72 
 
 
1056 aa  51.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.66 
 
 
220 aa  51.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.52 
 
 
265 aa  51.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
505 aa  51.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 
722 aa  50.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
718 aa  50.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 
892 aa  50.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 
626 aa  50.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.54 
 
 
887 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.46 
 
 
156 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  40 
 
 
739 aa  51.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  31.67 
 
 
456 aa  50.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  23 
 
 
279 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.42 
 
 
603 aa  50.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
4079 aa  50.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.19 
 
 
733 aa  50.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 
697 aa  51.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  27.91 
 
 
192 aa  50.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  19.12 
 
 
750 aa  50.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 
270 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 
688 aa  50.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00505  TAL effector AvrBs3/PthA  24.1 
 
 
653 aa  50.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.467766  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  35.71 
 
 
436 aa  50.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  29.7 
 
 
219 aa  50.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 
1737 aa  50.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  29.79 
 
 
1154 aa  50.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.74 
 
 
818 aa  50.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 
423 aa  50.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  35.79 
 
 
1073 aa  50.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0640  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
516 aa  49.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.76 
 
 
1022 aa  49.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.95 
 
 
784 aa  49.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>