107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4440 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 393 aa  771    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  46.68 
 
 		 387 aa  279  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  43.05 
 
 		 373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  38.16 
 
 		 345 aa  225  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  71.24 
 
 		 344 aa  224  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  69.66 
 
 		 215 aa  216  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  62.67 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  60.96 
 
 		 196 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  60.84 
 
 		 178 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  60.27 
 
 		 219 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  60.69 
 
 		 188 aa  176  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  60.14 
 
 		 190 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  60 
 
 		 190 aa  172  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  60.71 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  51.7 
 
 		 319 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  43.66 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.5 
 
 		 254 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 251 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1940  TPR domain-containing protein  39.72 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  36.65 
 
 		 251 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 221 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  33.85 
 
 		 251 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 251 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  38.73 
 
 		 221 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 251 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.25 
 
 		 302 aa  109  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1657  TPR domain-containing protein  38.85 
 
 		 283 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2682  TPR domain-containing protein  38.85 
 
 		 283 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  43.2 
 
 		 271 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2160  TPR domain-containing protein  38.85 
 
 		 240 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3155  TPR domain-containing protein  38.85 
 
 		 240 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2546  TPR repeat-containing protein  38.85 
 
 		 240 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2597  TPR repeat-containing protein  38.85 
 
 		 240 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1433  TPR domain-containing protein  38.85 
 
 		 240 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302375  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  41.79 
 
 		 216 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  43.31 
 
 		 216 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 625 aa  102  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  40.65 
 
 		 219 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 		 216 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40.74 
 
 		 636 aa  99.8  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  43.12 
 
 		 251 aa  93.2  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 878 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  35.35 
 
 		 820 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 649 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  30.54 
 
 		 538 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36 
 
 		 810 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 3172 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.07 
 
 		 633 aa  60.1  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  28.03 
 
 		 1101 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  40.96 
 
 		 589 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  35.85 
 
 		 561 aa  56.6  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 836 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 1451 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.46 
 
 		 875 aa  56.2  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  27.46 
 
 		 540 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 1454 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 265 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  35.85 
 
 		 561 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.4 
 
 		 1056 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  30.33 
 
 		 837 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  26.86 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.99 
 
 		 639 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.87 
 
 		 632 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.56 
 
 		 247 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  27.13 
 
 		 272 aa  53.9  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 295 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.37 
 
 		 699 aa  52.8  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.21 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1753  hypothetical protein  27.1 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1406 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 827 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 608 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 605 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  31.11 
 
 		 269 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  36.29 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 685 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.87 
 
 		 1694 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.61 
 
 		 622 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.23 
 
 		 988 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 649 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 649 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  30.6 
 
 		 594 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1226  hypothetical protein  28.79 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.03 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 243 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 629 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 502 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 646 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.27 
 
 		 642 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1276 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3450  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 174 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 522 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.61 
 
 		 764 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 917 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 643 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 667 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>