79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2083 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 460 aa  879    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  61.38 
 
 		 344 aa  179  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  53.49 
 
 		 373 aa  176  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  53.89 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  60.71 
 
 		 393 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  51.83 
 
 		 345 aa  172  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  56.08 
 
 		 215 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  52.15 
 
 		 196 aa  166  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  53.85 
 
 		 366 aa  166  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  52.76 
 
 		 188 aa  163  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  45.98 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  47.3 
 
 		 219 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  51.43 
 
 		 178 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  50.71 
 
 		 190 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  50.71 
 
 		 190 aa  138  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 		 625 aa  110  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.53 
 
 		 254 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 251 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 221 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 251 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 221 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  39.18 
 
 		 218 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  43.65 
 
 		 251 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  43.65 
 
 		 251 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  42.22 
 
 		 298 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1657  TPR domain-containing protein  47.71 
 
 		 283 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2682  TPR domain-containing protein  47.71 
 
 		 283 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 251 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1433  TPR domain-containing protein  47.71 
 
 		 240 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2597  TPR repeat-containing protein  47.71 
 
 		 240 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2160  TPR domain-containing protein  47.71 
 
 		 240 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3155  TPR domain-containing protein  47.71 
 
 		 240 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2546  TPR repeat-containing protein  46.79 
 
 		 240 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1940  TPR domain-containing protein  45.87 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 271 aa  99.8  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.53 
 
 		 302 aa  89.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40.74 
 
 		 636 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  38.13 
 
 		 216 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  44.33 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  43.75 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  42.27 
 
 		 251 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  38.03 
 
 		 708 aa  56.6  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  31.52 
 
 		 2821 aa  56.2  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 3145 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  32.07 
 
 		 848 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1372  hypothetical protein  44.3 
 
 		 344 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.63 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0559  trans-sialidase  49.37 
 
 		 331 aa  54.7  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  50 
 
 		 285 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  33.33 
 
 		 1101 aa  51.2  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.91 
 
 		 620 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 827 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 847 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  28.74 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3812  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  44.17 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.458595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1160  hypothetical protein  35.85 
 
 		 566 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0788241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0498  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.13 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  37.88 
 
 		 222 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  26.22 
 
 		 514 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  42.65 
 
 		 542 aa  47.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.97 
 
 		 725 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0558  hypothetical protein  44.3 
 
 		 243 aa  46.2  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.362885 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  29 
 
 		 633 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 729 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 795 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 295 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.98 
 
 		 642 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 620 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 878 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 		 361 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  32.74 
 
 		 577 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.05 
 
 		 620 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  32.74 
 
 		 577 aa  43.9  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  30.84 
 
 		 538 aa  43.5  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 		 589 aa  43.5  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1753  hypothetical protein  40.58 
 
 		 271 aa  43.1  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3223  OmpA/MotB domain-containing protein  61.54 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.943443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>