84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0857 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  57.96 
 
 
1514 aa  1530    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  52.59 
 
 
1527 aa  1283    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  100 
 
 
2821 aa  5721    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  55.48 
 
 
1475 aa  1471    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  31.99 
 
 
1363 aa  518  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  24.55 
 
 
1557 aa  149  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.41 
 
 
762 aa  122  7.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  29.74 
 
 
757 aa  120  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  29.47 
 
 
651 aa  102  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  28.1 
 
 
602 aa  87.8  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  32.23 
 
 
811 aa  88.2  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  26.76 
 
 
324 aa  87.4  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  29.84 
 
 
613 aa  87.4  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  31.1 
 
 
807 aa  86.3  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  29.47 
 
 
550 aa  82  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  33.51 
 
 
502 aa  81.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  36.07 
 
 
2495 aa  80.9  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  30.17 
 
 
342 aa  80.1  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  30.07 
 
 
753 aa  79.7  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  32.21 
 
 
592 aa  79.3  0.0000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  31.05 
 
 
330 aa  78.2  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  30.15 
 
 
478 aa  77.8  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  25.34 
 
 
532 aa  77.4  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  28.79 
 
 
750 aa  73.9  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  27 
 
 
316 aa  72.8  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  26.85 
 
 
430 aa  72.4  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  46.97 
 
 
538 aa  72.4  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  27.41 
 
 
737 aa  70.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  24.15 
 
 
817 aa  69.7  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  28.7 
 
 
454 aa  68.6  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  28.81 
 
 
573 aa  65.9  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  24.54 
 
 
890 aa  64.7  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  25.96 
 
 
532 aa  64.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  29.27 
 
 
512 aa  62.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  27.37 
 
 
587 aa  61.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  25.46 
 
 
331 aa  60.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  28.41 
 
 
1131 aa  59.7  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  28.41 
 
 
1131 aa  59.7  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  31.02 
 
 
434 aa  59.7  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  31.25 
 
 
302 aa  59.3  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  33.33 
 
 
440 aa  58.9  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  31.46 
 
 
377 aa  58.2  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  22.29 
 
 
499 aa  57  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.54 
 
 
339 aa  56.6  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  23.21 
 
 
420 aa  56.6  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0277  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
355 aa  56.2  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  29.92 
 
 
2196 aa  55.5  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  25.79 
 
 
1002 aa  55.5  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  24.77 
 
 
1025 aa  54.7  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  23.5 
 
 
474 aa  54.3  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  30.65 
 
 
589 aa  54.7  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  27.8 
 
 
552 aa  54.7  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  25.79 
 
 
1009 aa  53.9  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  43.84 
 
 
697 aa  53.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  28.34 
 
 
465 aa  53.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  36.84 
 
 
549 aa  53.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  23.03 
 
 
513 aa  51.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  23.03 
 
 
513 aa  51.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  23.03 
 
 
513 aa  51.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  20.97 
 
 
492 aa  52  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  23.03 
 
 
513 aa  51.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  23.03 
 
 
513 aa  51.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.02 
 
 
514 aa  50.8  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0022042  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  29.89 
 
 
648 aa  50.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  27.23 
 
 
184 aa  49.7  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  23 
 
 
513 aa  49.7  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2985  hypothetical protein  17.09 
 
 
318 aa  49.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  29.06 
 
 
483 aa  48.9  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.49 
 
 
533 aa  48.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  38.36 
 
 
203 aa  48.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  28.47 
 
 
722 aa  48.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.06 
 
 
399 aa  48.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  29.57 
 
 
578 aa  47.8  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  24.68 
 
 
3521 aa  47.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  33.33 
 
 
507 aa  47  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  42.86 
 
 
513 aa  47.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  21.86 
 
 
691 aa  47  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.83 
 
 
505 aa  47  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.876271  normal  0.0686016 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  35.87 
 
 
507 aa  46.2  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1160  hypothetical protein  26.62 
 
 
566 aa  46.2  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0788241  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0912  MerR family transcriptional regulator  23.48 
 
 
840 aa  46.2  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  29.79 
 
 
891 aa  46.2  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  28.74 
 
 
1732 aa  46.2  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  31.37 
 
 
488 aa  46.2  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>