171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1263 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 499 aa  1041    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  57.32 
 
 		 494 aa  581  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  57.67 
 
 		 488 aa  579  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  49.08 
 
 		 496 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  50.2 
 
 		 495 aa  482  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  50.2 
 
 		 495 aa  482  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  50.2 
 
 		 495 aa  482  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  50.2 
 
 		 495 aa  482  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  50.4 
 
 		 495 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  49.8 
 
 		 494 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  49.6 
 
 		 494 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  49.8 
 
 		 494 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  49.8 
 
 		 494 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  49.6 
 
 		 494 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  50.2 
 
 		 495 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  50 
 
 		 495 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  48.79 
 
 		 495 aa  470  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  49.39 
 
 		 507 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  48.57 
 
 		 507 aa  455  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  46.84 
 
 		 549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  45.84 
 
 		 627 aa  438  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  46.08 
 
 		 513 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  45.38 
 
 		 513 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  45.38 
 
 		 513 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  45.38 
 
 		 513 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  46.28 
 
 		 513 aa  428  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  45.18 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  45.84 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  45.12 
 
 		 492 aa  424  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  45.36 
 
 		 483 aa  412  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  44.13 
 
 		 488 aa  410  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  43.29 
 
 		 481 aa  393  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  43.09 
 
 		 480 aa  386  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  43 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  41.31 
 
 		 472 aa  362  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  41.78 
 
 		 486 aa  358  9.999999999999999e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  38.99 
 
 		 576 aa  319  7.999999999999999e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  34.38 
 
 		 516 aa  265  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  34.71 
 
 		 623 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  26.58 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  24.75 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  27.97 
 
 		 479 aa  106  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  27.32 
 
 		 364 aa  99.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  38.39 
 
 		 456 aa  95.1  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  24.62 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  25.07 
 
 		 639 aa  77  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  26.09 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  23.54 
 
 		 979 aa  70.9  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  24.04 
 
 		 624 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  23.82 
 
 		 583 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  24.8 
 
 		 607 aa  67  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  22.62 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  22.47 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  20.82 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2435  alpha amylase catalytic region  27.39 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  21.49 
 
 		 646 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  26.57 
 
 		 595 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  24.5 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  21.58 
 
 		 662 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  25.52 
 
 		 524 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  22.06 
 
 		 583 aa  57.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  22.41 
 
 		 665 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  22.54 
 
 		 511 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  22.29 
 
 		 2821 aa  56.6  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  22.67 
 
 		 1121 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  22.92 
 
 		 515 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  27.16 
 
 		 449 aa  55.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  25.6 
 
 		 593 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  23.77 
 
 		 533 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  26.74 
 
 		 462 aa  53.9  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  24.17 
 
 		 1105 aa  53.5  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  21.37 
 
 		 527 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  21.85 
 
 		 778 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  24.4 
 
 		 654 aa  52.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  22.22 
 
 		 600 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  21.24 
 
 		 1527 aa  52.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  25.41 
 
 		 654 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  23.36 
 
 		 528 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  23.1 
 
 		 814 aa  52  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  26.27 
 
 		 554 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  21.29 
 
 		 509 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  20.87 
 
 		 610 aa  50.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  33.98 
 
 		 1363 aa  50.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  22.87 
 
 		 1888 aa  50.1  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  23.53 
 
 		 649 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  24.38 
 
 		 575 aa  50.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  21.88 
 
 		 653 aa  50.1  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  22.62 
 
 		 588 aa  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  21.97 
 
 		 786 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  22.74 
 
 		 593 aa  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4088  alpha amylase, catalytic region  27.54 
 
 		 563 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  21.95 
 
 		 655 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  22.9 
 
 		 555 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  23.5 
 
 		 562 aa  50.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  23.03 
 
 		 1114 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  22.31 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  22.52 
 
 		 455 aa  49.3  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  26.87 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  22.15 
 
 		 914 aa  49.3  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  24.3 
 
 		 541 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>