161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_35756 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  100 
 
 
410 aa  854    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  48.34 
 
 
517 aa  417  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  48 
 
 
979 aa  399  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  42.11 
 
 
607 aa  329  5.0000000000000004e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  40.82 
 
 
447 aa  307  3e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0201  alpha amylase catalytic region  29.69 
 
 
513 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  30.37 
 
 
555 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  28.9 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  27.09 
 
 
469 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  25.9 
 
 
364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  24.09 
 
 
516 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  24.62 
 
 
623 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  26.4 
 
 
456 aa  90.5  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  24.86 
 
 
479 aa  87.4  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  23.6 
 
 
486 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  24.27 
 
 
494 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  21.69 
 
 
483 aa  73.6  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  21.72 
 
 
614 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  23 
 
 
492 aa  67  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  23.89 
 
 
499 aa  66.6  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  22.62 
 
 
499 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  23.81 
 
 
439 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  22 
 
 
481 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  22.63 
 
 
472 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  22.13 
 
 
462 aa  64.3  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  23.5 
 
 
488 aa  63.5  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  21.37 
 
 
480 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  22.92 
 
 
507 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  25.77 
 
 
679 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  20.54 
 
 
493 aa  60.8  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  22.54 
 
 
488 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  22.65 
 
 
507 aa  60.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  22.05 
 
 
495 aa  60.1  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  24.49 
 
 
495 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  24.49 
 
 
495 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  24.49 
 
 
495 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  21.43 
 
 
627 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  24.68 
 
 
495 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  24.68 
 
 
495 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  24.68 
 
 
495 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  24.49 
 
 
495 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  22.89 
 
 
494 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  25.39 
 
 
521 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  21.31 
 
 
510 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  23.6 
 
 
441 aa  57  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  25 
 
 
524 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  23 
 
 
496 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  23.21 
 
 
549 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  22.84 
 
 
494 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  21.47 
 
 
665 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  22.63 
 
 
494 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  23.99 
 
 
575 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  22.84 
 
 
494 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  24.12 
 
 
258 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  22.84 
 
 
494 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  22.41 
 
 
654 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  23.58 
 
 
441 aa  54.7  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  20.86 
 
 
562 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  23.33 
 
 
715 aa  53.5  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  22.56 
 
 
683 aa  53.1  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  21.01 
 
 
483 aa  52.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  21.27 
 
 
511 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  23.75 
 
 
644 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  21.5 
 
 
513 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  21.15 
 
 
513 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  25 
 
 
752 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  19.33 
 
 
555 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  26.67 
 
 
682 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  21.19 
 
 
513 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  20.99 
 
 
513 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  21.19 
 
 
513 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  24.92 
 
 
545 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  22.26 
 
 
641 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  20.95 
 
 
493 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  21.19 
 
 
513 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0191  glycosy hydrolase family protein  25.29 
 
 
534 aa  50.1  0.00007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  22.61 
 
 
586 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  23.81 
 
 
588 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  20.12 
 
 
686 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  22.28 
 
 
481 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  20.87 
 
 
583 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  22.57 
 
 
486 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  20.9 
 
 
586 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  20.29 
 
 
665 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  20.9 
 
 
586 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  19.02 
 
 
555 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  23.38 
 
 
559 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  23.03 
 
 
642 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  21.41 
 
 
654 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  23.67 
 
 
470 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  23.15 
 
 
914 aa  47.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  21.66 
 
 
515 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  24.33 
 
 
563 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  25.55 
 
 
541 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  21.41 
 
 
509 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  21.12 
 
 
484 aa  47.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  19.82 
 
 
639 aa  47.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  23.7 
 
 
958 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  24.61 
 
 
541 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  21.46 
 
 
513 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>