147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1387 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  65.18 
 
 		 495 aa  690    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  63.36 
 
 		 495 aa  681    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  65.18 
 
 		 495 aa  691    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  65.18 
 
 		 495 aa  691    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  100 
 
 		 496 aa  1026    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  65.38 
 
 		 495 aa  692    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  65.18 
 
 		 495 aa  691    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  65.18 
 
 		 495 aa  691    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  64.5 
 
 		 494 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  63.89 
 
 		 494 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  64.3 
 
 		 494 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  64.5 
 
 		 494 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  64.3 
 
 		 494 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  65.18 
 
 		 495 aa  691    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  52.15 
 
 		 488 aa  539  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  53.48 
 
 		 494 aa  520  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  49.08 
 
 		 499 aa  485  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  46.23 
 
 		 507 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  46.31 
 
 		 507 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  44.17 
 
 		 472 aa  415  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  43.74 
 
 		 627 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  44.42 
 
 		 549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  42.14 
 
 		 483 aa  396  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  41.51 
 
 		 488 aa  392  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  41.8 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  41.92 
 
 		 513 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  40.98 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  42.13 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  40.52 
 
 		 492 aa  381  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  41.51 
 
 		 513 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  41.72 
 
 		 513 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  41.51 
 
 		 513 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  41.72 
 
 		 513 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  41.51 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  39.75 
 
 		 486 aa  342  9e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  38.21 
 
 		 483 aa  342  1e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  37.98 
 
 		 576 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  35.6 
 
 		 623 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  33.66 
 
 		 516 aa  249  9e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  28.02 
 
 		 469 aa  170  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  28.31 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  28.12 
 
 		 479 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  26.49 
 
 		 456 aa  133  7.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  26.59 
 
 		 364 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  23.92 
 
 		 979 aa  72.4  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  24.17 
 
 		 1527 aa  64.7  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  21.61 
 
 		 517 aa  63.5  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  26.67 
 
 		 545 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  22.7 
 
 		 593 aa  61.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  28.37 
 
 		 524 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  26.48 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  24.55 
 
 		 1942 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  37.11 
 
 		 1363 aa  60.8  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  26.2 
 
 		 541 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  22.17 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  30.07 
 
 		 642 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  23.17 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  21.34 
 
 		 564 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  23.02 
 
 		 607 aa  58.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  24.39 
 
 		 614 aa  57.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  23.67 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  23.37 
 
 		 1017 aa  57  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  23 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  23.01 
 
 		 644 aa  56.6  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  23.5 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  21.07 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  23.64 
 
 		 662 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  26.63 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  22.33 
 
 		 1891 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  25.75 
 
 		 647 aa  53.9  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  22.78 
 
 		 665 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  20 
 
 		 604 aa  53.5  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 555 aa  53.5  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  24.47 
 
 		 765 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  22.03 
 
 		 646 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  27.27 
 
 		 649 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  26.39 
 
 		 258 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  21.66 
 
 		 526 aa  51.6  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  26.16 
 
 		 555 aa  51.2  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  23.97 
 
 		 624 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.81 
 
 		 1855 aa  50.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  22.96 
 
 		 723 aa  50.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  23.83 
 
 		 552 aa  50.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  20.57 
 
 		 610 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  20.95 
 
 		 815 aa  49.7  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  21.66 
 
 		 582 aa  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  20.28 
 
 		 2821 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  24.47 
 
 		 925 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  21.98 
 
 		 620 aa  48.9  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  30.25 
 
 		 439 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  23.5 
 
 		 639 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  25.47 
 
 		 595 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  21.53 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  21.54 
 
 		 767 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  24.14 
 
 		 499 aa  48.5  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  19.93 
 
 		 610 aa  48.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  22.56 
 
 		 739 aa  47.8  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  24.7 
 
 		 549 aa  47.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  24.61 
 
 		 778 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  21.05 
 
 		 653 aa  47.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>