126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_18258 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  100 
 
 		 517 aa  1084    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  48.34 
 
 		 410 aa  417  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  46.1 
 
 		 979 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  40.77 
 
 		 447 aa  317  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  38.73 
 
 		 607 aa  286  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0201  alpha amylase catalytic region  27.15 
 
 		 513 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  28.26 
 
 		 555 aa  137  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  25.18 
 
 		 516 aa  124  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  25.4 
 
 		 469 aa  120  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  28.27 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  25.88 
 
 		 456 aa  107  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  27.27 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  25.46 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  25.26 
 
 		 494 aa  100  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  25.25 
 
 		 623 aa  99.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  24.52 
 
 		 488 aa  92  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  23.32 
 
 		 483 aa  90.5  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  25.57 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  24.48 
 
 		 513 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  24.74 
 
 		 513 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  24.74 
 
 		 513 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  24.11 
 
 		 507 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  24.75 
 
 		 507 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  23.2 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  24.48 
 
 		 513 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  23.48 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  24.74 
 
 		 513 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  23.66 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  22.67 
 
 		 472 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  24.48 
 
 		 513 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  24.87 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  23.7 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  24.61 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 		 499 aa  77  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  24.61 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  23.44 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  24.04 
 
 		 627 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  23.33 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  23.44 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  23.44 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  23.44 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  23.44 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  24.09 
 
 		 494 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  23.44 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  24.23 
 
 		 513 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  23.83 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  24.1 
 
 		 549 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  24.45 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  23.3 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  23.79 
 
 		 481 aa  73.6  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  23.68 
 
 		 555 aa  73.2  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  23.2 
 
 		 555 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  23.45 
 
 		 576 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  21.61 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  24.23 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  22.98 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  21.02 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  26.19 
 
 		 815 aa  59.3  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  22.85 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  26.58 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  22.54 
 
 		 490 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  22.36 
 
 		 453 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  22.19 
 
 		 511 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  24.26 
 
 		 258 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  24.85 
 
 		 499 aa  55.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  24.56 
 
 		 679 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  24.75 
 
 		 524 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  26.58 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  23.9 
 
 		 515 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  21.81 
 
 		 644 aa  52.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0193  alpha amylase family protein  28.74 
 
 		 541 aa  52  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  21.09 
 
 		 561 aa  51.2  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  21.54 
 
 		 739 aa  50.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  27.59 
 
 		 560 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  22.98 
 
 		 620 aa  49.7  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  34.25 
 
 		 758 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  24.16 
 
 		 553 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  23.08 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  26.67 
 
 		 458 aa  48.5  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  21.58 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  21.7 
 
 		 521 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0191  glycosy hydrolase family protein  21.84 
 
 		 534 aa  48.1  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  21.2 
 
 		 838 aa  48.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  31.43 
 
 		 654 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  21.69 
 
 		 614 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  23.98 
 
 		 556 aa  47.4  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  21.4 
 
 		 576 aa  47.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  26.19 
 
 		 707 aa  47  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl499  trehalose-6-phosphate hydrolase  25.27 
 
 		 539 aa  47.4  0.0007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  25.15 
 
 		 561 aa  47  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  21.94 
 
 		 683 aa  47  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  20.73 
 
 		 422 aa  47  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  30.43 
 
 		 647 aa  47  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  22.8 
 
 		 544 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  24.46 
 
 		 545 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  29.11 
 
 		 593 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  34.33 
 
 		 654 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  21.47 
 
 		 836 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  26.17 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  21.43 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>