More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0544 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 758 aa  1487    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  35.82 
 
 		 728 aa  374  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  36.11 
 
 		 674 aa  355  2e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  39.07 
 
 		 682 aa  289  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  33.19 
 
 		 752 aa  272  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  31.86 
 
 		 687 aa  184  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  31.88 
 
 		 644 aa  158  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  33.33 
 
 		 654 aa  156  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  29.59 
 
 		 515 aa  154  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  27.02 
 
 		 562 aa  153  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  30.36 
 
 		 459 aa  153  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  28.69 
 
 		 459 aa  150  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  28.41 
 
 		 467 aa  147  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  33.42 
 
 		 524 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  31.9 
 
 		 479 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  32.17 
 
 		 479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  29.01 
 
 		 635 aa  142  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  31.48 
 
 		 499 aa  140  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  31.77 
 
 		 522 aa  135  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  32.46 
 
 		 541 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  28.8 
 
 		 622 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  26.76 
 
 		 434 aa  134  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  31.23 
 
 		 555 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  33.15 
 
 		 541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  27.45 
 
 		 426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  31.89 
 
 		 545 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  28.96 
 
 		 426 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  30.95 
 
 		 555 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  28.95 
 
 		 481 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  27.37 
 
 		 616 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  27.17 
 
 		 450 aa  129  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  28.65 
 
 		 582 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  27.34 
 
 		 568 aa  126  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  27.88 
 
 		 463 aa  125  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  28.38 
 
 		 562 aa  124  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  27.99 
 
 		 561 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  27.48 
 
 		 585 aa  124  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  37.89 
 
 		 258 aa  124  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.72 
 
 		 560 aa  124  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  30.75 
 
 		 441 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  25.1 
 
 		 481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  26.15 
 
 		 422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  30.14 
 
 		 509 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  29.65 
 
 		 493 aa  122  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  30.41 
 
 		 544 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  27.75 
 
 		 561 aa  120  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  29.22 
 
 		 455 aa  120  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  27.05 
 
 		 576 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  27.74 
 
 		 488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  32.28 
 
 		 588 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  30.21 
 
 		 441 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.02 
 
 		 556 aa  118  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  27.18 
 
 		 481 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  30.59 
 
 		 454 aa  118  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  27.86 
 
 		 486 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  28.61 
 
 		 510 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  27.76 
 
 		 590 aa  117  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  30.67 
 
 		 591 aa  117  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  26.08 
 
 		 551 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  27.51 
 
 		 554 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  30.9 
 
 		 598 aa  117  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  25.6 
 
 		 422 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  25.57 
 
 		 588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  27.3 
 
 		 554 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  27.25 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  27.25 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  27.08 
 
 		 486 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  29.31 
 
 		 583 aa  116  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  26.74 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  30.81 
 
 		 587 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  27.25 
 
 		 554 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  27.25 
 
 		 554 aa  115  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  27.25 
 
 		 554 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  27.25 
 
 		 554 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  28.85 
 
 		 472 aa  115  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1837  alpha amylase domain-containing protein  28.87 
 
 		 557 aa  115  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  26.76 
 
 		 557 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  27.07 
 
 		 598 aa  114  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  25.11 
 
 		 478 aa  114  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  28.54 
 
 		 586 aa  114  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  28.41 
 
 		 511 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  26.32 
 
 		 554 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  26.5 
 
 		 554 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  26.32 
 
 		 554 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  26.61 
 
 		 574 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  26.06 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  28.76 
 
 		 533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  34.01 
 
 		 552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  28.86 
 
 		 588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  26.57 
 
 		 601 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  27.4 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  25.54 
 
 		 481 aa  111  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  23.97 
 
 		 589 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  25.73 
 
 		 549 aa  111  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  25.73 
 
 		 549 aa  111  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  26.01 
 
 		 562 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  30.68 
 
 		 496 aa  110  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1336  alpha amylase catalytic region  35.29 
 
 		 565 aa  110  7.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  23.13 
 
 		 530 aa  110  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  35.58 
 
 		 571 aa  110  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>