More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1837 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1837  alpha amylase domain-containing protein  100 
 
 		 557 aa  1132    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0498  alpha amylase domain-containing protein  89.86 
 
 		 553 aa  1022    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.0360992 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  47.76 
 
 		 1100 aa  497  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  47.16 
 
 		 1110 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  45.67 
 
 		 1105 aa  490  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  44.89 
 
 		 1113 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  47.11 
 
 		 1088 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  46.46 
 
 		 1099 aa  483  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  47.17 
 
 		 1088 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  46.48 
 
 		 1088 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  47.57 
 
 		 1108 aa  485  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  47.12 
 
 		 1130 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  46.48 
 
 		 1088 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  46.93 
 
 		 1085 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  47.17 
 
 		 1100 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  46.9 
 
 		 1123 aa  479  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  46.15 
 
 		 1092 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  44.26 
 
 		 1114 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  46.37 
 
 		 553 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  45.86 
 
 		 1121 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  46.01 
 
 		 1098 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  45.47 
 
 		 1093 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  45.75 
 
 		 1119 aa  478  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  46.93 
 
 		 572 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  46.44 
 
 		 1105 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  46.74 
 
 		 1139 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  46.93 
 
 		 553 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  46.58 
 
 		 1088 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  46.25 
 
 		 1106 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  45.82 
 
 		 1108 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  45.82 
 
 		 1108 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  46.78 
 
 		 601 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  46.68 
 
 		 1138 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  46.55 
 
 		 572 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  46.13 
 
 		 1152 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  45.96 
 
 		 1164 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  47.33 
 
 		 591 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  46.68 
 
 		 1137 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  44.77 
 
 		 1121 aa  474  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  44.61 
 
 		 1115 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  45.96 
 
 		 1164 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  46.68 
 
 		 1137 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  46.44 
 
 		 1106 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  46.25 
 
 		 1106 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  45.17 
 
 		 1111 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  46.13 
 
 		 1131 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  45.3 
 
 		 1094 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  46.13 
 
 		 1131 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  45.89 
 
 		 1121 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  46.64 
 
 		 1100 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  46.04 
 
 		 1112 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  46.68 
 
 		 1137 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  47.99 
 
 		 604 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  46.13 
 
 		 1137 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  46.79 
 
 		 577 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  46.13 
 
 		 1131 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  44.49 
 
 		 1102 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  44.36 
 
 		 1088 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  45.81 
 
 		 1105 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  44.79 
 
 		 548 aa  469  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  46.64 
 
 		 1100 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  46.13 
 
 		 1131 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  46.13 
 
 		 1131 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  45.67 
 
 		 1142 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  46.03 
 
 		 1136 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  45.96 
 
 		 1160 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  46.34 
 
 		 567 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  45.94 
 
 		 1131 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  45.54 
 
 		 1113 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  44.49 
 
 		 1102 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  45.88 
 
 		 1100 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  45.19 
 
 		 1154 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  45.77 
 
 		 562 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  44.78 
 
 		 1108 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  44.93 
 
 		 1098 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  45.44 
 
 		 1093 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  45.94 
 
 		 1137 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  44.67 
 
 		 1102 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  46.75 
 
 		 556 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  45.64 
 
 		 1108 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  45.49 
 
 		 551 aa  463  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  45.19 
 
 		 1154 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  43.77 
 
 		 1100 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  45.76 
 
 		 1110 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  45.79 
 
 		 606 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  45.21 
 
 		 1095 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  48.44 
 
 		 558 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  44.42 
 
 		 1098 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  44.85 
 
 		 1100 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  46.2 
 
 		 574 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  47.16 
 
 		 596 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  45.07 
 
 		 1109 aa  461  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  46 
 
 		 551 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  47.16 
 
 		 596 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  46.52 
 
 		 585 aa  461  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  47.16 
 
 		 596 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  43.3 
 
 		 1112 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  45.79 
 
 		 1134 aa  455  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  44.36 
 
 		 1101 aa  458  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  45.49 
 
 		 1116 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>