More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2968 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  63.6 
 
 
1137 aa  758    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  65.74 
 
 
1088 aa  788    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  63.52 
 
 
1111 aa  734    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  66.67 
 
 
1106 aa  785    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  67.03 
 
 
1100 aa  786    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  67.94 
 
 
1101 aa  803    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  65.87 
 
 
1160 aa  767    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  66.48 
 
 
1105 aa  785    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  62.71 
 
 
1099 aa  741    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  62.85 
 
 
1131 aa  746    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  64.27 
 
 
572 aa  727    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  62.87 
 
 
1098 aa  746    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  65.82 
 
 
1108 aa  783    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  65.19 
 
 
1088 aa  772    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  66.67 
 
 
1106 aa  785    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  66.67 
 
 
1106 aa  785    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  66.18 
 
 
1110 aa  788    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  88.41 
 
 
572 aa  1025    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  63.64 
 
 
1154 aa  761    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  62.66 
 
 
1131 aa  743    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  65.82 
 
 
1108 aa  782    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  62.79 
 
 
606 aa  722    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  66.18 
 
 
1121 aa  790    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  65.19 
 
 
1095 aa  767    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  65.62 
 
 
1094 aa  766    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  68.83 
 
 
1104 aa  817    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  66.67 
 
 
1113 aa  791    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  65.31 
 
 
1164 aa  765    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  66.6 
 
 
1102 aa  780    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  63.6 
 
 
1138 aa  757    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  64.01 
 
 
1100 aa  756    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  65.03 
 
 
1093 aa  788    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  62.85 
 
 
1098 aa  740    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  65.86 
 
 
1109 aa  788    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  62.43 
 
 
1112 aa  741    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  63.9 
 
 
1110 aa  761    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  68.52 
 
 
1108 aa  792    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  65 
 
 
1061 aa  765    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  64.39 
 
 
1100 aa  762    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  63.33 
 
 
1085 aa  751    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  67.03 
 
 
1100 aa  778    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  65.99 
 
 
1100 aa  778    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  88.77 
 
 
572 aa  1027    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  65.19 
 
 
1088 aa  780    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  62.43 
 
 
574 aa  707    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  60.3 
 
 
1105 aa  722    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  67.03 
 
 
1100 aa  788    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  65.68 
 
 
1112 aa  792    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  62.85 
 
 
1131 aa  746    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  68.46 
 
 
1099 aa  787    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  62.22 
 
 
1094 aa  748    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  64.44 
 
 
1134 aa  749    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  63.64 
 
 
1154 aa  761    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  66.79 
 
 
1100 aa  775    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  67.4 
 
 
1100 aa  790    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  63.65 
 
 
551 aa  734    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  66.98 
 
 
1088 aa  795    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  63.89 
 
 
1101 aa  759    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  63.24 
 
 
1137 aa  756    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  65.36 
 
 
1108 aa  768    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  65.56 
 
 
1093 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  59.38 
 
 
556 aa  671    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  67.16 
 
 
1100 aa  804    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  63.09 
 
 
1152 aa  759    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  63.6 
 
 
1137 aa  758    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  63.89 
 
 
1130 aa  751    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  62.16 
 
 
596 aa  710    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  67.59 
 
 
1121 aa  805    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  66.17 
 
 
1115 aa  783    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  63.22 
 
 
1098 aa  754    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  56.04 
 
 
598 aa  639    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  60.55 
 
 
1116 aa  723    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  100 
 
 
553 aa  1142    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  62.85 
 
 
1131 aa  746    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  62.85 
 
 
1131 aa  746    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  65.09 
 
 
1108 aa  772    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  64.94 
 
 
1123 aa  758    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  63.24 
 
 
1137 aa  755    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  66.79 
 
 
1100 aa  776    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  62.16 
 
 
596 aa  710    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  66.6 
 
 
1102 aa  781    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  67.35 
 
 
1119 aa  787    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  65.31 
 
 
1164 aa  765    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  62.27 
 
 
601 aa  710    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  66.6 
 
 
1102 aa  780    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  65.19 
 
 
1092 aa  785    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  60.55 
 
 
1116 aa  722    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  61.28 
 
 
1105 aa  734    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  63.6 
 
 
1137 aa  758    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  65.3 
 
 
548 aa  758    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  65.49 
 
 
556 aa  738    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  61.48 
 
 
1121 aa  730    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  62.48 
 
 
1098 aa  736    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  62.75 
 
 
571 aa  718    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  65.74 
 
 
1088 aa  788    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  62.16 
 
 
596 aa  710    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  63.42 
 
 
1136 aa  758    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  88.41 
 
 
553 aa  1027    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  64.52 
 
 
1088 aa  773    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  66.6 
 
 
1142 aa  785    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>