More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09530 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  59.89 
 
 
562 aa  672    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  61.47 
 
 
572 aa  689    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  68.34 
 
 
587 aa  789    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  63.83 
 
 
596 aa  712    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  62.05 
 
 
606 aa  701    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  66.49 
 
 
585 aa  798    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  64.45 
 
 
604 aa  726    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  68.53 
 
 
567 aa  787    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  61.43 
 
 
574 aa  689    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  100 
 
 
616 aa  1266    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  62.17 
 
 
610 aa  709    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  63.12 
 
 
601 aa  706    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  64.21 
 
 
601 aa  721    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  62.9 
 
 
577 aa  709    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  60.71 
 
 
582 aa  689    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  63.83 
 
 
596 aa  712    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  68.21 
 
 
591 aa  792    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  69.31 
 
 
598 aa  817    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  61.47 
 
 
682 aa  709    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  67.14 
 
 
588 aa  810    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  62.37 
 
 
591 aa  700    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  68.13 
 
 
598 aa  805    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  58.66 
 
 
551 aa  650    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  62.82 
 
 
556 aa  707    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  61.33 
 
 
567 aa  697    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  61.06 
 
 
571 aa  701    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  70.1 
 
 
583 aa  820    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  63.83 
 
 
596 aa  712    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  57.35 
 
 
558 aa  622  1e-177  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  55.2 
 
 
1088 aa  623  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  55.2 
 
 
1088 aa  623  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  55.99 
 
 
556 aa  622  1e-177  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  56.08 
 
 
548 aa  621  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  53.86 
 
 
1092 aa  615  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  54.35 
 
 
551 aa  617  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  54.33 
 
 
1115 aa  616  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  52.93 
 
 
1088 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  54.22 
 
 
1088 aa  618  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  53.93 
 
 
1113 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  54.58 
 
 
1088 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  54.01 
 
 
1108 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  54.01 
 
 
1108 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  54.2 
 
 
1121 aa  611  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  54.37 
 
 
1106 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  54.24 
 
 
1121 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  53.83 
 
 
1106 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  53.63 
 
 
1136 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  53.2 
 
 
1164 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  53.63 
 
 
1137 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  53.83 
 
 
1105 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  53.63 
 
 
1137 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  53.83 
 
 
1106 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  55.14 
 
 
1119 aa  605  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  53.2 
 
 
1164 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  53.39 
 
 
1112 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  53.31 
 
 
1154 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  53.2 
 
 
1160 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  53.11 
 
 
1137 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  53.5 
 
 
1102 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  50.97 
 
 
1114 aa  598  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  51.72 
 
 
1102 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  53.86 
 
 
572 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  52.65 
 
 
1134 aa  598  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  52.95 
 
 
1154 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  53.05 
 
 
1152 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  53.11 
 
 
1137 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  52.92 
 
 
1100 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  53.11 
 
 
1137 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  51.66 
 
 
1085 aa  601  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  54.32 
 
 
1110 aa  595  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  52.95 
 
 
1104 aa  598  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  52.77 
 
 
1138 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  53.5 
 
 
572 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  52.88 
 
 
1112 aa  597  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  55.91 
 
 
1101 aa  598  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  53.5 
 
 
553 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  54.11 
 
 
553 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  52.92 
 
 
1100 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  51.55 
 
 
1102 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  53.24 
 
 
1100 aa  595  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  53.52 
 
 
1111 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  53.23 
 
 
1142 aa  594  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  51.93 
 
 
1113 aa  592  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  52.87 
 
 
1100 aa  593  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  54.12 
 
 
1108 aa  592  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  52.02 
 
 
1109 aa  595  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  52.42 
 
 
1131 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  52.42 
 
 
1131 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  52.42 
 
 
1131 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  52.42 
 
 
1131 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  54.26 
 
 
1109 aa  589  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  51.52 
 
 
1110 aa  588  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  52.42 
 
 
1131 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  52.25 
 
 
1100 aa  589  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  51.14 
 
 
1088 aa  590  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  51.81 
 
 
1093 aa  591  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  52.24 
 
 
1131 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  53.31 
 
 
1130 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  51.23 
 
 
1094 aa  588  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  51.56 
 
 
1099 aa  586  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>