More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1504 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 728 aa  1448    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  45.62 
 
 		 674 aa  555  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  35.62 
 
 		 758 aa  363  8e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  36.09 
 
 		 752 aa  354  4e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  34.44 
 
 		 682 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  30.35 
 
 		 687 aa  170  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  29.88 
 
 		 459 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  28.16 
 
 		 467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  32.09 
 
 		 459 aa  163  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  28.51 
 
 		 654 aa  160  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  30.41 
 
 		 450 aa  154  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  30.48 
 
 		 463 aa  153  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  26.03 
 
 		 478 aa  152  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  25.68 
 
 		 426 aa  151  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  27.33 
 
 		 515 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  31.41 
 
 		 479 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  23.87 
 
 		 499 aa  144  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  30.48 
 
 		 524 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  30.9 
 
 		 479 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  24.89 
 
 		 562 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  28.81 
 
 		 460 aa  139  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  25.35 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  27.34 
 
 		 510 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  28.36 
 
 		 552 aa  136  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  29.19 
 
 		 426 aa  136  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  26.04 
 
 		 533 aa  134  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  26.72 
 
 		 583 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  28.31 
 
 		 635 aa  130  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  25.38 
 
 		 422 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  24.94 
 
 		 422 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  27.42 
 
 		 541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  27.58 
 
 		 511 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  27.07 
 
 		 554 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  28.9 
 
 		 551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  25.75 
 
 		 538 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  25.11 
 
 		 575 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  25.98 
 
 		 554 aa  127  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  25.92 
 
 		 554 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  25.92 
 
 		 554 aa  127  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  25.74 
 
 		 554 aa  127  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  25.92 
 
 		 554 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  25.92 
 
 		 554 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 		 587 aa  127  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  29.33 
 
 		 525 aa  127  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  27.23 
 
 		 541 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  27.73 
 
 		 532 aa  127  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  26.04 
 
 		 554 aa  127  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  28.61 
 
 		 576 aa  127  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  27.91 
 
 		 554 aa  126  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  25.8 
 
 		 554 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  28.1 
 
 		 644 aa  125  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  28.29 
 
 		 545 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  27.86 
 
 		 493 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  29.17 
 
 		 601 aa  125  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  25.6 
 
 		 554 aa  125  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  27.97 
 
 		 593 aa  125  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  28.41 
 
 		 472 aa  124  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  25.7 
 
 		 588 aa  125  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  27.17 
 
 		 535 aa  124  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  25.76 
 
 		 477 aa  124  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  26.54 
 
 		 493 aa  124  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  28.49 
 
 		 535 aa  124  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  26.27 
 
 		 562 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  24.8 
 
 		 540 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  23.69 
 
 		 557 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  27.18 
 
 		 544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  23.77 
 
 		 589 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  27.63 
 
 		 575 aa  122  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  28.8 
 
 		 540 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  23.51 
 
 		 556 aa  121  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  24.55 
 
 		 543 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  28.29 
 
 		 555 aa  120  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  26.92 
 
 		 541 aa  120  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  24.52 
 
 		 563 aa  120  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  25.15 
 
 		 542 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  28.29 
 
 		 555 aa  120  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  28.36 
 
 		 598 aa  120  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  33.67 
 
 		 560 aa  120  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  24.76 
 
 		 1098 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  29.72 
 
 		 964 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  27.27 
 
 		 567 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  25.1 
 
 		 538 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  34.01 
 
 		 561 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  27.86 
 
 		 488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0498  alpha amylase domain-containing protein  28.71 
 
 		 553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.0360992 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.65 
 
 		 556 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  26.86 
 
 		 549 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  25.73 
 
 		 595 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  26.86 
 
 		 549 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  25.05 
 
 		 556 aa  118  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  29.07 
 
 		 596 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  29.07 
 
 		 596 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  29.07 
 
 		 596 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  26.47 
 
 		 555 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.87 
 
 		 538 aa  118  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  24.85 
 
 		 1100 aa  117  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  24.55 
 
 		 568 aa  118  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  23.93 
 
 		 583 aa  117  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  34.01 
 
 		 561 aa  117  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  28.87 
 
 		 564 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>