More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1713 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 426 aa  869    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  50.47 
 
 		 426 aa  478  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  37.31 
 
 		 422 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  37.06 
 
 		 422 aa  276  6e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  30.34 
 
 		 478 aa  209  8e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  32.68 
 
 		 463 aa  207  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  30.07 
 
 		 459 aa  206  7e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  33.62 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  27.75 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  32.97 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  32.19 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  28.64 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  25.68 
 
 		 728 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  24.21 
 
 		 674 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  27.45 
 
 		 758 aa  127  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.65 
 
 		 1433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2023  alpha amylase, catalytic region  32.17 
 
 		 707 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685343 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  24.75 
 
 		 682 aa  113  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1979  alpha amylase catalytic region  33.04 
 
 		 684 aa  113  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  29.47 
 
 		 1048 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  29.96 
 
 		 674 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  25.48 
 
 		 562 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  31.44 
 
 		 672 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  31.44 
 
 		 672 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3155  hypothetical protein  31.74 
 
 		 664 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  31.12 
 
 		 672 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2161  alpha amylase  32.61 
 
 		 680 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  28.26 
 
 		 1124 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  33.19 
 
 		 708 aa  106  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  28.42 
 
 		 1122 aa  106  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2534  Alpha amylase, catalytic region  30.7 
 
 		 664 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  30.88 
 
 		 1022 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  29.46 
 
 		 1131 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1297  alpha amylase catalytic region  30.17 
 
 		 667 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.774826  normal  0.698008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  28.52 
 
 		 1124 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  21.9 
 
 		 635 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3868  alpha amylase catalytic region  22.81 
 
 		 752 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  24.06 
 
 		 584 aa  104  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  27.75 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  28.52 
 
 		 1124 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  30.59 
 
 		 752 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36740  hypothetical protein  30.13 
 
 		 664 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.759208  normal  0.786637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  24.68 
 
 		 622 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  32.17 
 
 		 734 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  28.88 
 
 		 1126 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  26.19 
 
 		 610 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  23.4 
 
 		 586 aa  103  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  22.08 
 
 		 479 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  23.19 
 
 		 586 aa  103  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09540  glycosidase  28.51 
 
 		 715 aa  103  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0200177  normal  0.351025 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  29.44 
 
 		 816 aa  102  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  24.38 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  28.35 
 
 		 716 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  27.89 
 
 		 1146 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  26.26 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1105  alpha amylase catalytic region  29.36 
 
 		 705 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  31 
 
 		 1133 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  26.02 
 
 		 610 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  27.89 
 
 		 1151 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  31 
 
 		 1136 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  32.17 
 
 		 715 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  26.06 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  26.12 
 
 		 565 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  29.39 
 
 		 660 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  27.6 
 
 		 1144 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3678  alpha amylase, catalytic region  30.58 
 
 		 659 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  26.95 
 
 		 515 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1337  alpha amylase catalytic region  27.59 
 
 		 678 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  24.1 
 
 		 1088 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  22.22 
 
 		 524 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  23.97 
 
 		 606 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  25.89 
 
 		 524 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3176  alpha amylase catalytic region  29.74 
 
 		 682 aa  100  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000122162  hitchhiker  0.0000126185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  23.4 
 
 		 586 aa  99.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  23.4 
 
 		 586 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  29.05 
 
 		 651 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  23.19 
 
 		 586 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  23.4 
 
 		 586 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  23.98 
 
 		 510 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  23.19 
 
 		 586 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  28.95 
 
 		 652 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  30.4 
 
 		 651 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3846  alpha amylase, catalytic region  29.57 
 
 		 695 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0237577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3860  alpha amylase, catalytic region  29.57 
 
 		 695 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  27.58 
 
 		 1130 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3934  alpha amylase, catalytic region  29.57 
 
 		 695 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.538651 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  27.58 
 
 		 1130 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  23.19 
 
 		 586 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  23.19 
 
 		 586 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  22.38 
 
 		 1115 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  27.65 
 
 		 1074 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4097  alpha amylase catalytic sub domain protein  28.82 
 
 		 672 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0571346  normal  0.0314797 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  22.96 
 
 		 586 aa  98.2  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  31.3 
 
 		 724 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  24.22 
 
 		 545 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  24.35 
 
 		 511 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  25.83 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  25.83 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  22.98 
 
 		 586 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  23.59 
 
 		 434 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>