More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2732 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 
463 aa  947    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  54.59 
 
 
450 aa  478  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  51.42 
 
 
434 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  42.86 
 
 
467 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  39.82 
 
 
459 aa  345  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  36.62 
 
 
478 aa  302  7.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  35.59 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  35.99 
 
 
459 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  38.06 
 
 
422 aa  243  6e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  36.46 
 
 
422 aa  242  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  33.42 
 
 
426 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  32.68 
 
 
426 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  31.89 
 
 
1048 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  30.31 
 
 
728 aa  149  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  33.48 
 
 
524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 
479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  32.47 
 
 
479 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  30.33 
 
 
687 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  30.85 
 
 
682 aa  130  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  30.38 
 
 
674 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  23.72 
 
 
562 aa  123  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  28.34 
 
 
758 aa  117  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3868  alpha amylase catalytic region  26.43 
 
 
752 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  25.58 
 
 
552 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  29.6 
 
 
1146 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  29.91 
 
 
1151 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  34.06 
 
 
816 aa  106  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4138  alpha amylase catalytic region  28.39 
 
 
541 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  31.6 
 
 
681 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.08 
 
 
1433 aa  104  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  23.99 
 
 
586 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  25.71 
 
 
586 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10340  glycosidase  29.18 
 
 
663 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252003  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  23.77 
 
 
586 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  30.54 
 
 
752 aa  103  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  26.65 
 
 
635 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  34.58 
 
 
533 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  26.01 
 
 
510 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  23.57 
 
 
552 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  33.64 
 
 
550 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  24.67 
 
 
543 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  25.21 
 
 
499 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  25.33 
 
 
493 aa  100  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  22.53 
 
 
582 aa  100  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1337  alpha amylase catalytic region  29.77 
 
 
678 aa  100  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367678  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  24.22 
 
 
586 aa  100  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  23.9 
 
 
575 aa  99.8  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  32.41 
 
 
551 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0829  Alpha amylase, catalytic region  28.19 
 
 
662 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  33.5 
 
 
545 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  32.14 
 
 
716 aa  99.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  24.57 
 
 
551 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  34.7 
 
 
571 aa  99.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  29.72 
 
 
1122 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0331  alpha amylase catalytic region  32.22 
 
 
652 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0138  alpha amylase, catalytic region  26.11 
 
 
732 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  31.94 
 
 
688 aa  99  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1105  alpha amylase catalytic region  28.2 
 
 
705 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0034  alpha amylase catalytic region  30.03 
 
 
663 aa  98.6  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  26.01 
 
 
511 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  31.44 
 
 
1022 aa  98.2  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3583  alpha amylase catalytic region  32.02 
 
 
684 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  26.22 
 
 
654 aa  97.8  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0737  alpha amylase, catalytic region  32.31 
 
 
690 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.456985  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19040  glycosidase  33.04 
 
 
675 aa  97.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.000683856  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0314  alpha amylase, catalytic region  30.08 
 
 
646 aa  97.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 
492 aa  97.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  26.87 
 
 
651 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  28.77 
 
 
1122 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  23.42 
 
 
586 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  23.78 
 
 
586 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  23.78 
 
 
586 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  23.78 
 
 
586 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  26.1 
 
 
578 aa  96.7  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  23.78 
 
 
586 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  25 
 
 
576 aa  96.3  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  26.11 
 
 
484 aa  96.3  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  23.75 
 
 
752 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  27.44 
 
 
541 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  29.8 
 
 
652 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  33.81 
 
 
570 aa  95.5  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  26.27 
 
 
515 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2534  Alpha amylase, catalytic region  29.26 
 
 
664 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3678  alpha amylase, catalytic region  28.23 
 
 
659 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 
538 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1979  alpha amylase catalytic region  31.89 
 
 
684 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2537  alpha amylase, catalytic region  30.86 
 
 
692 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  27.85 
 
 
549 aa  94.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  23.56 
 
 
586 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  34.1 
 
 
544 aa  95.1  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1190  trehalose-6-phosphate hydrolase  33.84 
 
 
746 aa  95.1  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2161  alpha amylase  30.31 
 
 
680 aa  94.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  23.44 
 
 
2638 aa  95.1  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  27.3 
 
 
1124 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0861  alpha amylase catalytic region  30 
 
 
680 aa  94.4  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  33.5 
 
 
511 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3155  hypothetical protein  28.57 
 
 
664 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4097  alpha amylase catalytic sub domain protein  29.68 
 
 
672 aa  94  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0571346  normal  0.0314797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0520  Alpha amylase  30.19 
 
 
537 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  26.93 
 
 
541 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>