More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05105 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  100 
 
 		 478 aa  990    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  40.13 
 
 		 467 aa  345  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  37.05 
 
 		 459 aa  311  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  36.62 
 
 		 463 aa  302  8.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  38.07 
 
 		 450 aa  286  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  37.75 
 
 		 434 aa  286  5e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  34.29 
 
 		 459 aa  262  8e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  32.1 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  31.8 
 
 		 426 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  36.04 
 
 		 422 aa  217  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  35.74 
 
 		 422 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  30.34 
 
 		 426 aa  209  9e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  27.17 
 
 		 1048 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  26.03 
 
 		 728 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  26.46 
 
 		 687 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  27.21 
 
 		 511 aa  126  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  25.65 
 
 		 510 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  25.62 
 
 		 493 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  23.76 
 
 		 499 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  22.3 
 
 		 674 aa  114  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  26.41 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  27.13 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  26.15 
 
 		 479 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  27.27 
 
 		 522 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  26.1 
 
 		 654 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1984  alpha amylase domain-containing protein  25.83 
 
 		 671 aa  104  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  26.46 
 
 		 752 aa  103  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  25.78 
 
 		 515 aa  103  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  25.67 
 
 		 574 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  25.11 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  25.11 
 
 		 758 aa  100  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3583  alpha amylase catalytic region  24.74 
 
 		 684 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  24.46 
 
 		 682 aa  99.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  29.46 
 
 		 816 aa  99  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  27.86 
 
 		 560 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  30.56 
 
 		 544 aa  98.2  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  31.6 
 
 		 681 aa  98.2  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  24.5 
 
 		 505 aa  98.2  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  24.79 
 
 		 493 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  24.79 
 
 		 493 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  25.55 
 
 		 1021 aa  97.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  26.37 
 
 		 1146 aa  97.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  31.19 
 
 		 1124 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1337  alpha amylase catalytic region  26.99 
 
 		 678 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  24.66 
 
 		 635 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0679  alpha amylase, catalytic region  30.84 
 
 		 653 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1052  alpha amylase catalytic region  24.55 
 
 		 672 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  24.93 
 
 		 509 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  29.26 
 
 		 535 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  25.88 
 
 		 576 aa  94.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  26.93 
 
 		 815 aa  94.4  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  29.65 
 
 		 687 aa  94.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  26.17 
 
 		 484 aa  94.4  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1297  alpha amylase catalytic region  23.9 
 
 		 667 aa  93.6  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.774826  normal  0.698008 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 575 aa  93.6  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  28.12 
 
 		 716 aa  93.6  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3846  alpha amylase, catalytic region  25.55 
 
 		 695 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0237577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3155  hypothetical protein  23.97 
 
 		 664 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3860  alpha amylase, catalytic region  25.55 
 
 		 695 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3934  alpha amylase, catalytic region  25.55 
 
 		 695 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.538651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  29.41 
 
 		 555 aa  93.6  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  27.97 
 
 		 672 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  28.79 
 
 		 674 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  22.75 
 
 		 586 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  24.62 
 
 		 513 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  25.72 
 
 		 1151 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36740  hypothetical protein  24.24 
 
 		 664 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.759208  normal  0.786637 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0331  alpha amylase catalytic region  24.76 
 
 		 652 aa  92.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  27.41 
 
 		 672 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  26.88 
 
 		 651 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  30.14 
 
 		 1122 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  22.51 
 
 		 586 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  29.68 
 
 		 1122 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  25.07 
 
 		 762 aa  90.9  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  29.92 
 
 		 651 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  29.82 
 
 		 1124 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  29.82 
 
 		 1124 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  29.33 
 
 		 533 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  24.04 
 
 		 493 aa  90.9  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  26.63 
 
 		 1109 aa  90.5  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  24.48 
 
 		 586 aa  90.5  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2534  Alpha amylase, catalytic region  28.51 
 
 		 664 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  29.83 
 
 		 258 aa  90.1  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  27.88 
 
 		 672 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0210  alpha amylase catalytic region  28.12 
 
 		 676 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  22.62 
 
 		 562 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  29.82 
 
 		 1126 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  29.06 
 
 		 688 aa  89.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  26.26 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10340  glycosidase  27.68 
 
 		 663 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4301  alpha amylase, catalytic region  29.73 
 
 		 696 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844806 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  24.35 
 
 		 562 aa  89  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3678  alpha amylase, catalytic region  30.24 
 
 		 672 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.763851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  28.77 
 
 		 708 aa  89.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  27.39 
 
 		 609 aa  89  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  24.94 
 
 		 1093 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1809  alpha amylase, catalytic region  24.49 
 
 		 670 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341723  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0249  alpha amylase catalytic region  28.37 
 
 		 656 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1265  alpha amylase catalytic region  25.44 
 
 		 463 aa  88.2  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  24.05 
 
 		 582 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>