More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2652 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 682 aa  1355    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  57.24 
 
 		 752 aa  761    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  36.95 
 
 		 674 aa  382  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  34.44 
 
 		 728 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  38.88 
 
 		 758 aa  278  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  25.83 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  28.08 
 
 		 589 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  26.65 
 
 		 481 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  26.6 
 
 		 488 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  30.17 
 
 		 635 aa  154  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  28.54 
 
 		 459 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  22.74 
 
 		 562 aa  151  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  29.2 
 
 		 687 aa  151  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  31.44 
 
 		 524 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  26.88 
 
 		 654 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  29.35 
 
 		 487 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  31.36 
 
 		 479 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  26.02 
 
 		 493 aa  148  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  29.28 
 
 		 588 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  27.16 
 
 		 575 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  28.27 
 
 		 515 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  31.14 
 
 		 479 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  29.73 
 
 		 622 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  27.15 
 
 		 586 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  30.34 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  27.61 
 
 		 582 aa  145  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  27.78 
 
 		 481 aa  144  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  25.77 
 
 		 589 aa  143  9e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  28.44 
 
 		 510 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  26.43 
 
 		 586 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  26.93 
 
 		 586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  29.9 
 
 		 541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  27.48 
 
 		 549 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  26.05 
 
 		 586 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  29.66 
 
 		 586 aa  142  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  30.95 
 
 		 574 aa  141  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  27.24 
 
 		 545 aa  141  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  29.16 
 
 		 551 aa  140  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  26.71 
 
 		 586 aa  140  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  25.61 
 
 		 576 aa  140  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  26.71 
 
 		 586 aa  140  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  26.71 
 
 		 586 aa  140  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  29.94 
 
 		 545 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  26.71 
 
 		 586 aa  140  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  29.35 
 
 		 541 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  28 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  25.46 
 
 		 486 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  28.44 
 
 		 644 aa  139  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  29.82 
 
 		 532 aa  139  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  27 
 
 		 560 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  25.26 
 
 		 486 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  28.54 
 
 		 583 aa  137  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  27.68 
 
 		 554 aa  137  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  26.21 
 
 		 586 aa  137  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  28.86 
 
 		 593 aa  137  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  28.06 
 
 		 554 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  27.53 
 
 		 486 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  27.21 
 
 		 610 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  28.07 
 
 		 554 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  26.21 
 
 		 586 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  28.67 
 
 		 481 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  25.3 
 
 		 574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  28.29 
 
 		 481 aa  135  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  29.27 
 
 		 572 aa  135  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  27.67 
 
 		 536 aa  135  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  24.73 
 
 		 543 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  28.09 
 
 		 595 aa  135  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  27.61 
 
 		 554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  28.5 
 
 		 554 aa  134  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  27.44 
 
 		 459 aa  134  5e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  27.98 
 
 		 484 aa  133  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  24.19 
 
 		 663 aa  133  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  28.5 
 
 		 554 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  28.5 
 
 		 554 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  28.5 
 
 		 554 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  25.27 
 
 		 586 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0498  alpha amylase domain-containing protein  27.46 
 
 		 553 aa  133  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.0360992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  28.5 
 
 		 554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  28.5 
 
 		 554 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  28.5 
 
 		 554 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  28.02 
 
 		 587 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  25.74 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  25.74 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  27.94 
 
 		 548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  27.27 
 
 		 472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.07 
 
 		 556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.26 
 
 		 562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  25.38 
 
 		 561 aa  132  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  29.8 
 
 		 601 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  28.33 
 
 		 577 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  24.12 
 
 		 584 aa  131  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  27.47 
 
 		 539 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  26.87 
 
 		 555 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  27.57 
 
 		 496 aa  131  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  25.38 
 
 		 562 aa  130  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  26.02 
 
 		 554 aa  130  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  26.27 
 
 		 571 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  25.83 
 
 		 564 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  30.85 
 
 		 463 aa  130  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  28.34 
 
 		 601 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>