More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1154 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
752 aa  1512    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  57.6 
 
 
682 aa  760    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  34.78 
 
 
674 aa  360  4e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  35.62 
 
 
728 aa  359  9.999999999999999e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  35.84 
 
 
758 aa  210  9e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  26.5 
 
 
481 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  25.09 
 
 
687 aa  146  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  25.76 
 
 
589 aa  145  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  26.79 
 
 
575 aa  144  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  25.45 
 
 
488 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  27.85 
 
 
635 aa  142  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  29.09 
 
 
545 aa  140  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  24.64 
 
 
663 aa  140  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  24.61 
 
 
654 aa  140  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  26.19 
 
 
588 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  25.79 
 
 
586 aa  138  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  26.64 
 
 
549 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  28.48 
 
 
541 aa  137  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  28.43 
 
 
515 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  29.08 
 
 
481 aa  137  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  25.57 
 
 
582 aa  136  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  29.5 
 
 
541 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  24.14 
 
 
586 aa  135  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  28.05 
 
 
481 aa  135  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  24.01 
 
 
481 aa  134  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  25.66 
 
 
493 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  25.77 
 
 
486 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  30.05 
 
 
542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  25.77 
 
 
486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  28.89 
 
 
532 aa  132  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  24.14 
 
 
586 aa  131  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  24.14 
 
 
586 aa  131  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  24.14 
 
 
586 aa  131  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  24.83 
 
 
586 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  23.95 
 
 
586 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  24.02 
 
 
586 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  23.83 
 
 
586 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  26.77 
 
 
644 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  28.16 
 
 
481 aa  130  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  25.06 
 
 
586 aa  129  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  27.98 
 
 
496 aa  127  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  25.33 
 
 
574 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1934  alpha amylase catalytic region  26.68 
 
 
643 aa  127  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  25.28 
 
 
610 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  27.16 
 
 
554 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 
576 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  26.09 
 
 
554 aa  126  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  26.99 
 
 
554 aa  125  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  29.87 
 
 
541 aa  125  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  26.88 
 
 
554 aa  125  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  26.92 
 
 
554 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  26.92 
 
 
554 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  26.92 
 
 
554 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  26.99 
 
 
554 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  26.92 
 
 
554 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  26.39 
 
 
554 aa  125  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  25.43 
 
 
561 aa  124  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  27.65 
 
 
487 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  25.28 
 
 
459 aa  123  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  25.42 
 
 
484 aa  123  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  27.99 
 
 
454 aa  123  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  24.83 
 
 
610 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  25.3 
 
 
586 aa  121  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  28.81 
 
 
593 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  24.75 
 
 
561 aa  121  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  25.33 
 
 
486 aa  121  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  29 
 
 
606 aa  120  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  25.29 
 
 
472 aa  120  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  35.43 
 
 
524 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  28.7 
 
 
562 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  25.93 
 
 
556 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  25.49 
 
 
426 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  30.1 
 
 
538 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  31.67 
 
 
511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  26.59 
 
 
639 aa  118  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  27.38 
 
 
483 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2575  alpha amylase catalytic region  24.11 
 
 
604 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.260702  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  25.18 
 
 
538 aa  118  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  25.2 
 
 
583 aa  117  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  25.55 
 
 
554 aa  117  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  28.32 
 
 
535 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  27.02 
 
 
577 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  29.65 
 
 
539 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  27.93 
 
 
601 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  33.18 
 
 
479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  28.08 
 
 
567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  28.25 
 
 
591 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  27.09 
 
 
715 aa  116  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  33.8 
 
 
540 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  25.55 
 
 
551 aa  115  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  27.16 
 
 
554 aa  115  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  23.72 
 
 
560 aa  115  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  33.63 
 
 
459 aa  115  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  34.62 
 
 
554 aa  115  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  26.71 
 
 
578 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  26.07 
 
 
583 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  26.46 
 
 
521 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  29.64 
 
 
540 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  27.34 
 
 
572 aa  114  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  26.34 
 
 
574 aa  114  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>