More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01125 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  100 
 
 		 434 aa  909    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  56.18 
 
 		 450 aa  498  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  51.42 
 
 		 463 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  42.32 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  40.05 
 
 		 459 aa  346  4e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  36.57 
 
 		 459 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  36.67 
 
 		 460 aa  289  6e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  37.75 
 
 		 478 aa  286  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  36.32 
 
 		 422 aa  247  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  36.32 
 
 		 422 aa  246  8e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  38.05 
 
 		 426 aa  237  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  33.62 
 
 		 426 aa  206  8e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  32.66 
 
 		 1048 aa  159  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  29.68 
 
 		 524 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  30.02 
 
 		 479 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  30.02 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  28.26 
 
 		 687 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  26.33 
 
 		 674 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  25.35 
 
 		 728 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  24.7 
 
 		 562 aa  129  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  26.76 
 
 		 758 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  25.52 
 
 		 682 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  25.38 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  24.89 
 
 		 582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  24.26 
 
 		 576 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  24.62 
 
 		 511 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  23.85 
 
 		 492 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  24.31 
 
 		 575 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  23.71 
 
 		 589 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  23.67 
 
 		 752 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  23.37 
 
 		 586 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1190  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.02 
 
 		 746 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  25.28 
 
 		 499 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.35 
 
 		 1433 aa  100  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  25.75 
 
 		 541 aa  99.8  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  28.24 
 
 		 752 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  26.32 
 
 		 672 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0331  alpha amylase catalytic region  31.67 
 
 		 652 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3868  alpha amylase catalytic region  21.8 
 
 		 752 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  21.41 
 
 		 574 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  23.06 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  23.8 
 
 		 505 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0138  alpha amylase, catalytic region  24.82 
 
 		 732 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  24.62 
 
 		 586 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  24.37 
 
 		 586 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  32.02 
 
 		 816 aa  97.1  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  24.31 
 
 		 762 aa  96.7  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3155  hypothetical protein  26.28 
 
 		 664 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  23.01 
 
 		 477 aa  96.7  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  25.07 
 
 		 589 aa  95.9  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0393  alpha amylase catalytic region  23.95 
 
 		 735 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0232636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  30.15 
 
 		 688 aa  95.5  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2450  putative Alpha-amylase  26.4 
 
 		 592 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  23.89 
 
 		 554 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36740  hypothetical protein  26.28 
 
 		 664 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.759208  normal  0.786637 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  23.17 
 
 		 586 aa  94.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2089  alpha amylase catalytic region  30.04 
 
 		 679 aa  94  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  31.38 
 
 		 681 aa  94  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  30.19 
 
 		 1105 aa  94  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  23.29 
 
 		 526 aa  94  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  22.69 
 
 		 545 aa  93.6  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2435  alpha amylase catalytic region  22.83 
 
 		 451 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  28.46 
 
 		 652 aa  93.2  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  24.34 
 
 		 552 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  24.6 
 
 		 484 aa  93.2  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  22.97 
 
 		 2638 aa  93.2  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.72 
 
 		 592 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  0.551148 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  21.78 
 
 		 486 aa  93.2  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.12 
 
 		 587 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  24.1 
 
 		 481 aa  92.8  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  27.12 
 
 		 1146 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0737  alpha amylase, catalytic region  31.3 
 
 		 690 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.456985  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  31.82 
 
 		 534 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6072  alpha amylase catalytic region  31.09 
 
 		 659 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  33.13 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1279  alpha amylase catalytic region  30.7 
 
 		 666 aa  92.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0559691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  26.58 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  30.9 
 
 		 734 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  22.43 
 
 		 496 aa  92  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  22.57 
 
 		 522 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  30.99 
 
 		 671 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1052  alpha amylase catalytic region  30 
 
 		 672 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.81 
 
 		 598 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  23.21 
 
 		 552 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  23.65 
 
 		 554 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  22.19 
 
 		 588 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  30.34 
 
 		 1022 aa  91.3  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  30.9 
 
 		 715 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.64 
 
 		 561 aa  90.9  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0861  alpha amylase catalytic region  30.8 
 
 		 680 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  20.18 
 
 		 554 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  23.97 
 
 		 1144 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  22.22 
 
 		 541 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3678  alpha amylase, catalytic region  27.34 
 
 		 672 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.763851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  29.3 
 
 		 542 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  31.38 
 
 		 1122 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1984  alpha amylase domain-containing protein  23.19 
 
 		 671 aa  90.5  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  28.69 
 
 		 716 aa  90.5  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  22.1 
 
 		 480 aa  90.5  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  23.08 
 
 		 481 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>