More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0851 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  100 
 
 		 1433 aa  2941    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  29.83 
 
 		 655 aa  218  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  29.35 
 
 		 681 aa  205  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  30.28 
 
 		 659 aa  201  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  30.06 
 
 		 668 aa  199  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  29.14 
 
 		 678 aa  198  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  26.08 
 
 		 661 aa  197  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  27.96 
 
 		 661 aa  196  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  27.01 
 
 		 659 aa  196  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  28.21 
 
 		 678 aa  194  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  29.31 
 
 		 674 aa  194  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  28.63 
 
 		 659 aa  192  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  29.52 
 
 		 663 aa  191  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  27.44 
 
 		 662 aa  191  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  30.22 
 
 		 641 aa  189  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  26.93 
 
 		 660 aa  189  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  27.09 
 
 		 663 aa  186  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  31.89 
 
 		 675 aa  184  8.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  25.9 
 
 		 712 aa  184  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  28.96 
 
 		 610 aa  184  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  29.57 
 
 		 657 aa  183  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.26 
 
 		 662 aa  182  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  31.68 
 
 		 693 aa  181  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  29.33 
 
 		 660 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  25.04 
 
 		 672 aa  176  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  31.74 
 
 		 693 aa  175  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  28.92 
 
 		 657 aa  174  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  32.11 
 
 		 692 aa  174  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  28.92 
 
 		 657 aa  174  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  25.18 
 
 		 672 aa  172  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  29.73 
 
 		 672 aa  171  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  30.33 
 
 		 686 aa  163  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  30.8 
 
 		 720 aa  161  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  29.18 
 
 		 687 aa  155  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  26.03 
 
 		 652 aa  148  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  24.35 
 
 		 651 aa  145  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.92 
 
 		 659 aa  140  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  30.47 
 
 		 565 aa  134  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  27.62 
 
 		 614 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  25.6 
 
 		 611 aa  128  7e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.62 
 
 		 651 aa  127  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  26.67 
 
 		 734 aa  122  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  26.44 
 
 		 715 aa  121  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  30.39 
 
 		 426 aa  120  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0314  alpha amylase, catalytic region  25.28 
 
 		 646 aa  120  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  24.29 
 
 		 658 aa  119  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  25.98 
 
 		 724 aa  116  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  26.65 
 
 		 426 aa  115  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  25.22 
 
 		 1124 aa  114  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  25.55 
 
 		 1122 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  26.68 
 
 		 1151 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  24.94 
 
 		 1124 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  24.94 
 
 		 1124 aa  113  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  27.75 
 
 		 420 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  25.29 
 
 		 459 aa  112  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  27.05 
 
 		 1115 aa  110  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  27.05 
 
 		 1148 aa  110  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  28.32 
 
 		 433 aa  110  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  27.34 
 
 		 1136 aa  110  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  27.34 
 
 		 1115 aa  110  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  27.05 
 
 		 1115 aa  109  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  25.75 
 
 		 1146 aa  109  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  27.05 
 
 		 1115 aa  110  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  29.6 
 
 		 435 aa  109  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  25.66 
 
 		 1122 aa  108  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  23.7 
 
 		 1126 aa  108  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  25.59 
 
 		 1037 aa  108  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  26.67 
 
 		 1022 aa  107  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  26.26 
 
 		 671 aa  106  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  25.72 
 
 		 1196 aa  105  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  25.72 
 
 		 1196 aa  105  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  25.43 
 
 		 651 aa  104  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  24.85 
 
 		 1074 aa  104  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4227  Alpha amylase, catalytic region  26.45 
 
 		 1140 aa  103  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316311  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 688 aa  103  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  27.23 
 
 		 1130 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  28.79 
 
 		 422 aa  103  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  27.08 
 
 		 463 aa  104  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  25.69 
 
 		 1075 aa  103  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  25.85 
 
 		 459 aa  102  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  27.4 
 
 		 1133 aa  101  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  27.23 
 
 		 1136 aa  101  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  26.67 
 
 		 1082 aa  101  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  26.99 
 
 		 1130 aa  101  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  24.48 
 
 		 1201 aa  100  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0916  alpha amylase catalytic region  26.14 
 
 		 476 aa  100  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  26.74 
 
 		 684 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3678  alpha amylase, catalytic region  25.49 
 
 		 659 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  26.99 
 
 		 1130 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  27.27 
 
 		 422 aa  100  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  25.61 
 
 		 672 aa  99.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28010  family 13 glycosyl hydrolase  25.53 
 
 		 667 aa  100  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  25.54 
 
 		 708 aa  99.8  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  29.35 
 
 		 434 aa  100  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36740  hypothetical protein  25.61 
 
 		 664 aa  99.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.759208  normal  0.786637 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2030  alpha amylase domain-containing protein  24.52 
 
 		 672 aa  99  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219861  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  25.94 
 
 		 1144 aa  99  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3155  hypothetical protein  26.86 
 
 		 664 aa  98.6  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  24.72 
 
 		 672 aa  97.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  24.63 
 
 		 651 aa  97.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>