89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4305 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  53.37 
 
 		 712 aa  782    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  58.52 
 
 		 657 aa  800    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  61.27 
 
 		 662 aa  808    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  58.52 
 
 		 657 aa  800    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  58.42 
 
 		 681 aa  801    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 674 aa  1394    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  48.44 
 
 		 672 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  49.62 
 
 		 657 aa  611  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  44.75 
 
 		 655 aa  536  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  42.9 
 
 		 659 aa  525  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  43.42 
 
 		 663 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  41.69 
 
 		 661 aa  504  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  43.32 
 
 		 661 aa  499  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  43.54 
 
 		 668 aa  496  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  42.81 
 
 		 675 aa  484  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  40.61 
 
 		 663 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  42.11 
 
 		 678 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  41.1 
 
 		 660 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  42.27 
 
 		 678 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  40.18 
 
 		 659 aa  459  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  38.89 
 
 		 659 aa  432  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  40.12 
 
 		 652 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  42.04 
 
 		 692 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  42.14 
 
 		 693 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  38.48 
 
 		 686 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  41.43 
 
 		 693 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  35.33 
 
 		 672 aa  412  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  35.63 
 
 		 672 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  38.02 
 
 		 610 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  36.93 
 
 		 687 aa  401  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.69 
 
 		 659 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  38.44 
 
 		 641 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.89 
 
 		 662 aa  382  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  36.65 
 
 		 660 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  33.28 
 
 		 651 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  35.63 
 
 		 720 aa  349  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  31.17 
 
 		 614 aa  294  4e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  30.15 
 
 		 611 aa  294  4e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.08 
 
 		 651 aa  289  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  30.17 
 
 		 658 aa  277  5e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.52 
 
 		 656 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  31.77 
 
 		 565 aa  232  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.31 
 
 		 1433 aa  194  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  25.49 
 
 		 1593 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  25.44 
 
 		 1526 aa  95.5  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  26.55 
 
 		 1537 aa  89.7  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25 
 
 		 721 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.86 
 
 		 741 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.02 
 
 		 725 aa  65.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.63 
 
 		 751 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.02 
 
 		 741 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.15 
 
 		 720 aa  62  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.02 
 
 		 734 aa  61.2  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.53 
 
 		 760 aa  58.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.32 
 
 		 723 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  26.19 
 
 		 757 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  26.05 
 
 		 675 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  26.13 
 
 		 758 aa  53.5  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.44 
 
 		 698 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  24.75 
 
 		 758 aa  52.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  26.05 
 
 		 770 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.05 
 
 		 776 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.05 
 
 		 797 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.05 
 
 		 770 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.05 
 
 		 776 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25 
 
 		 741 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.62 
 
 		 740 aa  51.6  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.19 
 
 		 757 aa  51.6  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.18 
 
 		 732 aa  50.4  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.05 
 
 		 759 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.15 
 
 		 734 aa  49.7  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.6 
 
 		 720 aa  48.9  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.48 
 
 		 723 aa  48.1  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.36 
 
 		 612 aa  47.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.3 
 
 		 700 aa  47.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2170  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.18 
 
 		 676 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000556903  unclonable  0.00000000115329 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.88 
 
 		 719 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  32.35 
 
 		 698 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.66 
 
 		 733 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.32 
 
 		 764 aa  45.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.88 
 
 		 731 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.97 
 
 		 628 aa  45.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.96 
 
 		 708 aa  45.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.39 
 
 		 746 aa  44.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.59 
 
 		 732 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  25 
 
 		 765 aa  44.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.62 
 
 		 740 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.62 
 
 		 740 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.4 
 
 		 711 aa  43.9  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>