45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1681 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  100 
 
 		 658 aa  1366    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.77 
 
 		 651 aa  491  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  33.79 
 
 		 720 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  33.64 
 
 		 660 aa  307  3e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  30.68 
 
 		 659 aa  287  5e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  31.66 
 
 		 655 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  29.17 
 
 		 661 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  31.42 
 
 		 659 aa  283  8.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  30.5 
 
 		 663 aa  283  9e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  32.09 
 
 		 652 aa  277  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  30.17 
 
 		 674 aa  277  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  30.61 
 
 		 659 aa  270  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  29.37 
 
 		 661 aa  265  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  31.78 
 
 		 610 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  29.88 
 
 		 668 aa  259  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  28.49 
 
 		 681 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  28.61 
 
 		 657 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  29.68 
 
 		 662 aa  250  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  28.46 
 
 		 657 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.7 
 
 		 656 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  28.23 
 
 		 712 aa  242  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  27.6 
 
 		 672 aa  242  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  29.49 
 
 		 675 aa  239  8e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  30 
 
 		 611 aa  238  3e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  28.51 
 
 		 678 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  29.2 
 
 		 678 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  27.46 
 
 		 672 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  27.68 
 
 		 672 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  27.35 
 
 		 663 aa  232  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  26.07 
 
 		 687 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  30.34 
 
 		 693 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  30.21 
 
 		 693 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  29.86 
 
 		 692 aa  230  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  26.85 
 
 		 686 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.42 
 
 		 659 aa  224  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.09 
 
 		 662 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  30.09 
 
 		 614 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  28.37 
 
 		 660 aa  218  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  27.38 
 
 		 641 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  28.15 
 
 		 657 aa  207  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  23.75 
 
 		 651 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.96 
 
 		 565 aa  156  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.29 
 
 		 1433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  25.74 
 
 		 1526 aa  53.9  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  25.34 
 
 		 1537 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>