47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0888 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  100 
 
 
656 aa  1353    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  30.66 
 
 
660 aa  306  6e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  29.77 
 
 
659 aa  295  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  30.11 
 
 
659 aa  293  9e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  30.75 
 
 
663 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  29.52 
 
 
659 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  30.21 
 
 
661 aa  283  5.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  31.57 
 
 
655 aa  281  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  31.46 
 
 
610 aa  281  4e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  29.68 
 
 
672 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  30.72 
 
 
668 aa  277  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  29.46 
 
 
672 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  27.67 
 
 
661 aa  268  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  28.59 
 
 
657 aa  264  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  27.93 
 
 
652 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  29.52 
 
 
674 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  28.33 
 
 
657 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  28.33 
 
 
657 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  28.27 
 
 
663 aa  251  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  30.19 
 
 
720 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  28.7 
 
 
658 aa  246  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  26.15 
 
 
678 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  25.99 
 
 
678 aa  226  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  28.12 
 
 
681 aa  226  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.13 
 
 
651 aa  224  6e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  28.29 
 
 
662 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  25.91 
 
 
712 aa  217  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  28.77 
 
 
660 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  27.21 
 
 
686 aa  217  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  26.61 
 
 
687 aa  214  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  27.15 
 
 
641 aa  209  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.41 
 
 
662 aa  208  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  26.32 
 
 
675 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  25.86 
 
 
614 aa  196  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  28.22 
 
 
693 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  28.34 
 
 
692 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  26.04 
 
 
672 aa  191  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  27.62 
 
 
693 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  24.47 
 
 
651 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  25.59 
 
 
611 aa  183  8.000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.11 
 
 
659 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.77 
 
 
565 aa  146  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.74 
 
 
1433 aa  74.7  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  22.07 
 
 
1526 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.25 
 
 
725 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.08 
 
 
720 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.71 
 
 
723 aa  47.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>