80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0439 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  100 
 
 		 660 aa  1374    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  52.96 
 
 		 659 aa  691    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  51.63 
 
 		 659 aa  650    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  44.94 
 
 		 659 aa  537  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  43.71 
 
 		 663 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  44.12 
 
 		 668 aa  526  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  43.91 
 
 		 663 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  44.96 
 
 		 610 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  41.77 
 
 		 661 aa  510  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  43.45 
 
 		 655 aa  499  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  39.45 
 
 		 661 aa  484  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  41.43 
 
 		 672 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  41.1 
 
 		 674 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  40.81 
 
 		 672 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  41.35 
 
 		 662 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  38.11 
 
 		 652 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  38.41 
 
 		 681 aa  429  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  39.67 
 
 		 657 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  39.51 
 
 		 657 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  37.3 
 
 		 712 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  37.58 
 
 		 720 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  36.59 
 
 		 686 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  37.98 
 
 		 641 aa  412  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  38.65 
 
 		 657 aa  409  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  36.71 
 
 		 651 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  36.71 
 
 		 672 aa  398  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  37 
 
 		 662 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  35.12 
 
 		 687 aa  388  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  36 
 
 		 660 aa  382  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  37.13 
 
 		 678 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  36.84 
 
 		 678 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  36.2 
 
 		 675 aa  379  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  36.83 
 
 		 693 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  36.94 
 
 		 693 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  34.76 
 
 		 611 aa  367  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  36.6 
 
 		 692 aa  364  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  34 
 
 		 659 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  34.66 
 
 		 614 aa  335  2e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.36 
 
 		 651 aa  327  5e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  33.64 
 
 		 658 aa  307  3e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.66 
 
 		 656 aa  306  6e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.56 
 
 		 565 aa  291  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.93 
 
 		 1433 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  24.73 
 
 		 1593 aa  100  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  24.61 
 
 		 1526 aa  98.2  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  23.3 
 
 		 1537 aa  77  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.32 
 
 		 723 aa  65.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.8 
 
 		 725 aa  62.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.08 
 
 		 868 aa  60.8  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.88 
 
 		 698 aa  60.8  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.94 
 
 		 720 aa  60.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.32 
 
 		 682 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.56 
 
 		 741 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.11 
 
 		 741 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  25.11 
 
 		 727 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.6 
 
 		 734 aa  51.6  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  20.86 
 
 		 733 aa  50.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.01 
 
 		 623 aa  50.8  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.36 
 
 		 746 aa  50.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.96 
 
 		 685 aa  48.9  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.66 
 
 		 612 aa  48.5  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.87 
 
 		 757 aa  47.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.06 
 
 		 726 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.09 
 
 		 729 aa  47.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.15 
 
 		 759 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.43 
 
 		 723 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  23.08 
 
 		 1061 aa  47  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.37 
 
 		 735 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  22.62 
 
 		 715 aa  45.8  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  20.81 
 
 		 758 aa  45.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  20.56 
 
 		 675 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.86 
 
 		 718 aa  45.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.56 
 
 		 776 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.56 
 
 		 776 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  22.92 
 
 		 706 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.34 
 
 		 685 aa  44.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.79 
 
 		 781 aa  44.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.8 
 
 		 721 aa  44.7  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  21.47 
 
 		 698 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.95 
 
 		 708 aa  43.9  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>