85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0115 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  50.84 
 
 		 668 aa  685    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  53.48 
 
 		 663 aa  712    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  100 
 
 		 659 aa  1370    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  57.34 
 
 		 663 aa  781    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  47.71 
 
 		 655 aa  616  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  47.26 
 
 		 672 aa  615  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  47.26 
 
 		 672 aa  611  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  46.76 
 
 		 661 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  45.09 
 
 		 660 aa  550  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  44.66 
 
 		 659 aa  545  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  42.77 
 
 		 659 aa  545  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  42.9 
 
 		 674 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  42.02 
 
 		 661 aa  521  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  42.84 
 
 		 657 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  42.84 
 
 		 657 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  45.15 
 
 		 662 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  39.85 
 
 		 651 aa  497  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  40.54 
 
 		 681 aa  484  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  40.63 
 
 		 712 aa  481  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  42.61 
 
 		 610 aa  476  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  38.25 
 
 		 657 aa  464  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  39.28 
 
 		 678 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  39.22 
 
 		 672 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  39.31 
 
 		 675 aa  455  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  38.47 
 
 		 678 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  38.6 
 
 		 652 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  40.36 
 
 		 692 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  39.64 
 
 		 693 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  39.82 
 
 		 693 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  37.52 
 
 		 720 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  36.99 
 
 		 686 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.75 
 
 		 662 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  36.12 
 
 		 687 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  35.83 
 
 		 660 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  35.68 
 
 		 641 aa  392  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.21 
 
 		 659 aa  326  9e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  33.7 
 
 		 614 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  34.38 
 
 		 611 aa  311  2.9999999999999997e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.84 
 
 		 651 aa  301  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.02 
 
 		 656 aa  299  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  30.36 
 
 		 658 aa  277  5e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.21 
 
 		 565 aa  248  3e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.16 
 
 		 1433 aa  198  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  25.81 
 
 		 1537 aa  115  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  23.31 
 
 		 1526 aa  107  8e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  23.3 
 
 		 1593 aa  107  9e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.26 
 
 		 725 aa  77.4  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.68 
 
 		 698 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  25 
 
 		 727 aa  68.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.98 
 
 		 720 aa  66.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.36 
 
 		 685 aa  64.7  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.92 
 
 		 685 aa  63.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.91 
 
 		 723 aa  62.4  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.37 
 
 		 729 aa  55.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.65 
 
 		 741 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.13 
 
 		 729 aa  53.5  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.67 
 
 		 721 aa  52.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.53 
 
 		 776 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  22.42 
 
 		 706 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.7 
 
 		 734 aa  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.89 
 
 		 760 aa  52  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23 
 
 		 711 aa  50.8  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.06 
 
 		 741 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  23.04 
 
 		 758 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.18 
 
 		 734 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  17.44 
 
 		 733 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.61 
 
 		 759 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.78 
 
 		 746 aa  48.5  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.33 
 
 		 757 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.85 
 
 		 718 aa  48.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.12 
 
 		 623 aa  48.1  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.53 
 
 		 732 aa  48.1  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  24.6 
 
 		 729 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.2 
 
 		 735 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  19.75 
 
 		 732 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.28 
 
 		 720 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  22.48 
 
 		 757 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.4 
 
 		 740 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.49 
 
 		 682 aa  45.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.9 
 
 		 732 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.73 
 
 		 717 aa  45.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  21.95 
 
 		 797 aa  44.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 581 aa  45.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.42 
 
 		 740 aa  43.9  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000620  hypothetical protein  27.01 
 
 		 959 aa  43.9  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>