131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2125 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  57.02 
 
 		 734 aa  791    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  50.85 
 
 		 733 aa  649    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  58.73 
 
 		 741 aa  813    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.87 
 
 		 723 aa  669    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  51.15 
 
 		 731 aa  691    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  49.93 
 
 		 732 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  50.86 
 
 		 732 aa  683    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  51 
 
 		 735 aa  666    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  56.84 
 
 		 734 aa  805    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  50.29 
 
 		 733 aa  679    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  57 
 
 		 734 aa  792    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  51.13 
 
 		 765 aa  734    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  55.76 
 
 		 733 aa  752    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  49.13 
 
 		 778 aa  712    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  49.4 
 
 		 781 aa  709    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  51.65 
 
 		 764 aa  728    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  52.23 
 
 		 729 aa  711    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  49.13 
 
 		 778 aa  714    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  100 
 
 		 732 aa  1498    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  58.96 
 
 		 736 aa  811    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  51.34 
 
 		 729 aa  705    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  57.95 
 
 		 736 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  49.13 
 
 		 778 aa  711    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.9 
 
 		 740 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.76 
 
 		 740 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.76 
 
 		 741 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.76 
 
 		 740 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  45.09 
 
 		 770 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.95 
 
 		 740 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.12 
 
 		 717 aa  565  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.09 
 
 		 770 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.09 
 
 		 797 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.64 
 
 		 740 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.09 
 
 		 776 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.09 
 
 		 776 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.66 
 
 		 740 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  45.17 
 
 		 758 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  45.48 
 
 		 716 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.94 
 
 		 757 aa  558  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  41.9 
 
 		 757 aa  554  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.03 
 
 		 720 aa  553  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.15 
 
 		 711 aa  544  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  45 
 
 		 675 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.07 
 
 		 759 aa  538  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.33 
 
 		 735 aa  495  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.54 
 
 		 698 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.58 
 
 		 720 aa  481  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.94 
 
 		 751 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.03 
 
 		 721 aa  472  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.94 
 
 		 751 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  39.64 
 
 		 751 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.75 
 
 		 751 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  38.67 
 
 		 758 aa  467  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.77 
 
 		 708 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.57 
 
 		 760 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.64 
 
 		 725 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  36.39 
 
 		 727 aa  443  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.48 
 
 		 741 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.97 
 
 		 623 aa  439  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.62 
 
 		 741 aa  439  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.67 
 
 		 723 aa  435  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.52 
 
 		 746 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.39 
 
 		 724 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.41 
 
 		 612 aa  412  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.83 
 
 		 719 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.03 
 
 		 733 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.16 
 
 		 718 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.92 
 
 		 722 aa  381  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  37.91 
 
 		 715 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  35.46 
 
 		 723 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.45 
 
 		 700 aa  365  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.46 
 
 		 726 aa  364  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  39.44 
 
 		 712 aa  360  7e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  36.59 
 
 		 729 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.65 
 
 		 685 aa  356  7.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  36.54 
 
 		 706 aa  353  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.94 
 
 		 685 aa  353  7e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  36.85 
 
 		 737 aa  346  8e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.24 
 
 		 658 aa  341  4e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.73 
 
 		 734 aa  340  4e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.19 
 
 		 628 aa  304  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1671  amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.33 
 
 		 691 aa  301  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.813696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1677  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.99 
 
 		 691 aa  293  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.43 
 
 		 682 aa  276  7e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.94 
 
 		 654 aa  267  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.71 
 
 		 776 aa  256  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3955  hypothetical protein  32.09 
 
 		 716 aa  252  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148683  normal  0.0140585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06360  glycogen debranching enzyme  32.51 
 
 		 645 aa  249  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6734  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.47 
 
 		 708 aa  236  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1957  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.72 
 
 		 689 aa  215  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705949  decreased coverage  0.0000163059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  26.32 
 
 		 834 aa  101  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.58 
 
 		 868 aa  94  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  23.65 
 
 		 732 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2170  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.18 
 
 		 676 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000556903  unclonable  0.00000000115329 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  24.88 
 
 		 581 aa  69.7  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  25.51 
 
 		 659 aa  68.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  23.76 
 
 		 681 aa  67  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1790  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.88 
 
 		 676 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  21.56 
 
 		 852 aa  64.3  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  28.21 
 
 		 668 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>