117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5556 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  52.8 
 
 		 734 aa  748    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  53.3 
 
 		 733 aa  716    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  54.39 
 
 		 741 aa  766    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  48.99 
 
 		 723 aa  714    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  54.31 
 
 		 731 aa  766    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  53.63 
 
 		 732 aa  755    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  53.29 
 
 		 732 aa  747    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  53.9 
 
 		 735 aa  740    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  53.5 
 
 		 734 aa  768    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  52.76 
 
 		 733 aa  762    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  53.67 
 
 		 734 aa  776    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  52.55 
 
 		 733 aa  716    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  70.57 
 
 		 778 aa  1054    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  71.68 
 
 		 781 aa  1066    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  92.81 
 
 		 764 aa  1434    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  51.65 
 
 		 729 aa  739    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  71.37 
 
 		 778 aa  1053    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  51.48 
 
 		 732 aa  729    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  53.23 
 
 		 736 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  59.09 
 
 		 729 aa  847    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  71.2 
 
 		 778 aa  1055    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  100 
 
 		 765 aa  1560    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  53.34 
 
 		 736 aa  757    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.91 
 
 		 757 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  41.17 
 
 		 757 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.56 
 
 		 740 aa  547  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  43.17 
 
 		 770 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  43.17 
 
 		 758 aa  545  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.17 
 
 		 776 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.63 
 
 		 770 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.17 
 
 		 797 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.17 
 
 		 776 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.18 
 
 		 740 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.04 
 
 		 740 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  42.72 
 
 		 741 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.04 
 
 		 740 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.01 
 
 		 740 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.44 
 
 		 716 aa  538  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.9 
 
 		 740 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.1 
 
 		 759 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  43.49 
 
 		 675 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  41.35 
 
 		 720 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.88 
 
 		 711 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.94 
 
 		 735 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.87 
 
 		 720 aa  508  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.4 
 
 		 698 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.06 
 
 		 741 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.99 
 
 		 725 aa  475  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.87 
 
 		 721 aa  472  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.95 
 
 		 741 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  36.23 
 
 		 758 aa  466  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.26 
 
 		 708 aa  458  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.86 
 
 		 760 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  47.95 
 
 		 717 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  38.13 
 
 		 751 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.81 
 
 		 751 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.81 
 
 		 751 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.21 
 
 		 751 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  34.9 
 
 		 727 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.96 
 
 		 724 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.87 
 
 		 723 aa  419  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  39.3 
 
 		 715 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.62 
 
 		 746 aa  415  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.55 
 
 		 722 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.2 
 
 		 623 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.8 
 
 		 612 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.48 
 
 		 700 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  38.13 
 
 		 712 aa  389  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  35.44 
 
 		 723 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.67 
 
 		 733 aa  385  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.68 
 
 		 719 aa  375  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  34.78 
 
 		 729 aa  372  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.73 
 
 		 726 aa  372  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  47.43 
 
 		 718 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  35.67 
 
 		 737 aa  365  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  35.88 
 
 		 706 aa  363  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.89 
 
 		 685 aa  362  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.35 
 
 		 734 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.11 
 
 		 685 aa  352  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.93 
 
 		 628 aa  326  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1671  amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.48 
 
 		 691 aa  320  7.999999999999999e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.813696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1677  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.24 
 
 		 691 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  42.99 
 
 		 658 aa  313  9e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.45 
 
 		 682 aa  283  7.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3955  hypothetical protein  34.19 
 
 		 716 aa  282  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148683  normal  0.0140585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06360  glycogen debranching enzyme  44.53 
 
 		 645 aa  269  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.39 
 
 		 654 aa  268  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6734  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.71 
 
 		 708 aa  248  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.93 
 
 		 776 aa  238  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1957  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.8 
 
 		 689 aa  220  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705949  decreased coverage  0.0000163059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  28.86 
 
 		 834 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.49 
 
 		 868 aa  111  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  24.05 
 
 		 732 aa  77.8  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 		 581 aa  65.9  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  24.47 
 
 		 708 aa  65.1  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  22.73 
 
 		 810 aa  63.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  25.08 
 
 		 610 aa  61.2  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  23.74 
 
 		 657 aa  57.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1790  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.42 
 
 		 676 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  20 
 
 		 852 aa  55.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>