146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0360 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  100 
 
 		 852 aa  1740    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  44.57 
 
 		 732 aa  635  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  44.09 
 
 		 708 aa  627  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  42.63 
 
 		 721 aa  622  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  40.81 
 
 		 718 aa  609  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  40.76 
 
 		 738 aa  595  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  41.95 
 
 		 717 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  37.94 
 
 		 783 aa  533  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  38.19 
 
 		 783 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  38.7 
 
 		 790 aa  532  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  37.56 
 
 		 783 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  37.69 
 
 		 783 aa  527  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  37.56 
 
 		 783 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  37.69 
 
 		 783 aa  528  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  37.56 
 
 		 783 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  37.56 
 
 		 783 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  36.4 
 
 		 896 aa  334  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  30.47 
 
 		 896 aa  267  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  25.2 
 
 		 581 aa  125  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  27.07 
 
 		 543 aa  121  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  25.3 
 
 		 444 aa  111  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  25.41 
 
 		 745 aa  97.4  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  22.35 
 
 		 452 aa  96.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  24.43 
 
 		 566 aa  93.2  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  25.32 
 
 		 681 aa  87.8  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  21.31 
 
 		 433 aa  87.8  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  22.27 
 
 		 431 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  21.71 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  23.71 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.48 
 
 		 734 aa  73.6  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  21.98 
 
 		 575 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  22.48 
 
 		 476 aa  73.2  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  21.19 
 
 		 423 aa  70.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  22.39 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  21.9 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.47 
 
 		 731 aa  65.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  22.07 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  27.64 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.31 
 
 		 732 aa  65.1  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.95 
 
 		 734 aa  65.1  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.06 
 
 		 725 aa  65.1  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.03 
 
 		 760 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  21.55 
 
 		 432 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.41 
 
 		 732 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  21.09 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  20.54 
 
 		 733 aa  62.4  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.14 
 
 		 781 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  22.3 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.01 
 
 		 723 aa  60.8  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.24 
 
 		 721 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.97 
 
 		 729 aa  60.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.71 
 
 		 741 aa  60.1  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  21.24 
 
 		 419 aa  60.1  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  21.16 
 
 		 914 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.32 
 
 		 708 aa  60.1  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  21.92 
 
 		 514 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  21.92 
 
 		 514 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.43 
 
 		 720 aa  58.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  21.69 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  21.54 
 
 		 723 aa  57.4  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  23.16 
 
 		 758 aa  56.2  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.77 
 
 		 734 aa  56.6  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.73 
 
 		 778 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.46 
 
 		 778 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  20.95 
 
 		 727 aa  56.2  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6603  hypothetical protein  23.08 
 
 		 914 aa  56.2  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.59 
 
 		 741 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  20 
 
 		 765 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  22.71 
 
 		 474 aa  55.1  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4938  glucosidase  24.14 
 
 		 896 aa  55.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0850212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.58 
 
 		 735 aa  54.7  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  20.35 
 
 		 452 aa  54.3  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.46 
 
 		 778 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2302  hypothetical protein  26.96 
 
 		 903 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0370449  hitchhiker  0.000942014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  22.78 
 
 		 439 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.53 
 
 		 764 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1574  glucosidase  29.3 
 
 		 890 aa  53.5  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.786209  normal  0.991499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.16 
 
 		 711 aa  52.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39865  Mannosyl-oligosaccharide glucosidase (Processing A-glucosidase I) (Glucosidase I)  21.86 
 
 		 833 aa  53.1  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.589522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.56 
 
 		 732 aa  53.5  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  21.62 
 
 		 440 aa  52.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0214  hypothetical protein  25.96 
 
 		 933 aa  52.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  19.55 
 
 		 736 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  32.58 
 
 		 446 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.64 
 
 		 685 aa  52.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  19.61 
 
 		 612 aa  52  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  22.38 
 
 		 729 aa  52  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.34 
 
 		 759 aa  52  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7096  hypothetical protein  25.96 
 
 		 935 aa  52  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  19.52 
 
 		 757 aa  51.6  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  31.82 
 
 		 450 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.46 
 
 		 719 aa  51.6  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  31.82 
 
 		 446 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  31.82 
 
 		 446 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  19.95 
 
 		 740 aa  51.2  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6278  hypothetical protein  21.33 
 
 		 913 aa  50.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.71 
 
 		 736 aa  51.2  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  19.5 
 
 		 510 aa  50.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2091  hypothetical protein  23.43 
 
 		 917 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.91 
 
 		 734 aa  50.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>