104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4151 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  56.41 
 
 		 717 aa  799    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  61.05 
 
 		 738 aa  904    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  65.69 
 
 		 718 aa  1004    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 721 aa  1489    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  42.63 
 
 		 852 aa  621  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  42.54 
 
 		 708 aa  548  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  42.11 
 
 		 732 aa  528  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  34.35 
 
 		 783 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  34.6 
 
 		 783 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  34.35 
 
 		 783 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  34.35 
 
 		 783 aa  438  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  34.35 
 
 		 783 aa  438  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  34.35 
 
 		 783 aa  439  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  33.8 
 
 		 783 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  35.03 
 
 		 790 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  34.09 
 
 		 783 aa  432  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  32.18 
 
 		 896 aa  256  8e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  31.76 
 
 		 896 aa  223  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 581 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  27.65 
 
 		 444 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  26.24 
 
 		 452 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  28.04 
 
 		 543 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  25 
 
 		 478 aa  108  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  25.58 
 
 		 441 aa  103  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  25 
 
 		 445 aa  101  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  27.46 
 
 		 745 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  23.59 
 
 		 566 aa  92.4  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  25 
 
 		 423 aa  91.7  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  30.54 
 
 		 476 aa  88.6  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  22.78 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  24.29 
 
 		 575 aa  80.9  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  23.54 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  32.7 
 
 		 401 aa  79.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  23.86 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  25.17 
 
 		 440 aa  73.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  23.71 
 
 		 456 aa  72  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  25.99 
 
 		 681 aa  70.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  23.33 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  22.41 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  23.37 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6278  hypothetical protein  22.89 
 
 		 913 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4427  hypothetical protein  25.47 
 
 		 901 aa  61.6  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6603  hypothetical protein  22.18 
 
 		 914 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  23.45 
 
 		 495 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0406  hypothetical protein  24.26 
 
 		 919 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  22.64 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  22.64 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3385  hypothetical protein  23.32 
 
 		 890 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0706228 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1748  hypothetical protein  24.34 
 
 		 911 aa  58.2  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0575728  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  21.43 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  20.83 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1812  hypothetical protein  22.84 
 
 		 913 aa  57.4  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17410  hypothetical protein  25.26 
 
 		 912 aa  57.4  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.567848  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  25.11 
 
 		 439 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  20.91 
 
 		 510 aa  56.6  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0399  hypothetical protein  24.2 
 
 		 915 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0409  hypothetical protein  24.2 
 
 		 915 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  24.13 
 
 		 441 aa  55.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  22.03 
 
 		 424 aa  54.3  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4938  glucosidase  20.91 
 
 		 896 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0850212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  22.2 
 
 		 446 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  20.78 
 
 		 509 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  21.51 
 
 		 446 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2091  hypothetical protein  22.95 
 
 		 917 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3230  hypothetical protein  25.95 
 
 		 891 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3773  hypothetical protein  24 
 
 		 887 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.63 
 
 		 725 aa  53.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.18 
 
 		 708 aa  52.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1861  hypothetical protein  22.73 
 
 		 892 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.14 
 
 		 722 aa  51.6  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5404  hypothetical protein  23.69 
 
 		 896 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.379787  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.55 
 
 		 700 aa  51.6  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  36.05 
 
 		 468 aa  51.2  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  25.29 
 
 		 544 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.83 
 
 		 734 aa  50.4  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1574  glucosidase  26.87 
 
 		 890 aa  48.9  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.786209  normal  0.991499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2813  glucosidase  21.95 
 
 		 881 aa  48.5  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.125423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0119  Alpha,alpha-trehalase  27.69 
 
 		 529 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2302  hypothetical protein  23.31 
 
 		 903 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0370449  hitchhiker  0.000942014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.45 
 
 		 724 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.79 
 
 		 732 aa  47.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.18 
 
 		 718 aa  47.4  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.95 
 
 		 732 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  21.47 
 
 		 729 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4082  hypothetical protein  22.01 
 
 		 522 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.09 
 
 		 734 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4080  hypothetical protein  23.13 
 
 		 912 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1943  hypothetical protein  21.48 
 
 		 891 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637433  normal  0.041134 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  32.18 
 
 		 450 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  32.18 
 
 		 446 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  32.18 
 
 		 446 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7096  hypothetical protein  21.33 
 
 		 935 aa  45.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.47 
 
 		 765 aa  45.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1838  hypothetical protein  22.26 
 
 		 893 aa  45.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.307747  normal  0.469868 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  27.05 
 
 		 452 aa  45.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3896  hypothetical protein  26.74 
 
 		 870 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6985  hypothetical protein  20.37 
 
 		 895 aa  45.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0673  hypothetical protein  22.95 
 
 		 910 aa  44.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0857899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3337  hypothetical protein  26.53 
 
 		 737 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0214  hypothetical protein  20.98 
 
 		 933 aa  44.3  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>